Protein–RNA interactions for Protein: O70137

Alx3, Homeobox protein aristaless-like 3, mousemouse

Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Alx3O70137 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Alx3O70137 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Alx3O70137 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Alx3O70137 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Alx3O70137 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Alx3O70137 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Alx3O70137 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Alx3O70137 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Alx3O70137 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Alx3O70137 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Alx3O70137 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Alx3O70137 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Alx3O70137 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Alx3O70137 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Alx3O70137 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Alx3O70137 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Alx3O70137 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Alx3O70137 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Alx3O70137 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Alx3O70137 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Alx3O70137 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Alx3O70137 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Alx3O70137 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Alx3O70137 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Alx3O70137 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Alx3O70137 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Alx3O70137 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Alx3O70137 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Alx3O70137 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Alx3O70137 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Alx3O70137 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Alx3O70137 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Alx3O70137 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Alx3O70137 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Alx3O70137 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Alx3O70137 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Alx3O70137 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Alx3O70137 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Alx3O70137 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Alx3O70137 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Alx3O70137 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Alx3O70137 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Alx3O70137 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Alx3O70137 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Alx3O70137 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Alx3O70137 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Alx3O70137 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Alx3O70137 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Alx3O70137 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Alx3O70137 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Alx3O70137 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Alx3O70137 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Alx3O70137 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Alx3O70137 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Alx3O70137 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Alx3O70137 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Alx3O70137 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Alx3O70137 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Alx3O70137 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Alx3O70137 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Alx3O70137 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Alx3O70137 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Alx3O70137 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Alx3O70137 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Alx3O70137 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Alx3O70137 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Alx3O70137 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Alx3O70137 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Alx3O70137 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Alx3O70137 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Alx3O70137 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Alx3O70137 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Alx3O70137 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Alx3O70137 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Alx3O70137 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Alx3O70137 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Alx3O70137 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Alx3O70137 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Alx3O70137 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Alx3O70137 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Alx3O70137 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Alx3O70137 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Alx3O70137 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Alx3O70137 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Alx3O70137 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Alx3O70137 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Alx3O70137 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Alx3O70137 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Alx3O70137 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Alx3O70137 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Alx3O70137 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Alx3O70137 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Alx3O70137 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Alx3O70137 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Alx3O70137 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Alx3O70137 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Alx3O70137 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Alx3O70137 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Alx3O70137 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Alx3O70137 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms