Protein–RNA interactions for Protein: O55236

Rngtt, mRNA-capping enzyme, mousemouse

Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RngttO55236 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RngttO55236 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
RngttO55236 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RngttO55236 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RngttO55236 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RngttO55236 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RngttO55236 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RngttO55236 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RngttO55236 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RngttO55236 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RngttO55236 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RngttO55236 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RngttO55236 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RngttO55236 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RngttO55236 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RngttO55236 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RngttO55236 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RngttO55236 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RngttO55236 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RngttO55236 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RngttO55236 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RngttO55236 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
RngttO55236 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RngttO55236 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RngttO55236 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RngttO55236 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RngttO55236 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
RngttO55236 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RngttO55236 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RngttO55236 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RngttO55236 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RngttO55236 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RngttO55236 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RngttO55236 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RngttO55236 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RngttO55236 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
RngttO55236 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
RngttO55236 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RngttO55236 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RngttO55236 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RngttO55236 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RngttO55236 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RngttO55236 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RngttO55236 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RngttO55236 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RngttO55236 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RngttO55236 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RngttO55236 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RngttO55236 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RngttO55236 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RngttO55236 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RngttO55236 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RngttO55236 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RngttO55236 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RngttO55236 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RngttO55236 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
RngttO55236 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RngttO55236 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RngttO55236 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RngttO55236 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RngttO55236 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RngttO55236 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RngttO55236 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RngttO55236 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RngttO55236 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RngttO55236 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RngttO55236 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RngttO55236 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RngttO55236 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RngttO55236 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RngttO55236 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RngttO55236 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
RngttO55236 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RngttO55236 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RngttO55236 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RngttO55236 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RngttO55236 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RngttO55236 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RngttO55236 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RngttO55236 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RngttO55236 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RngttO55236 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
RngttO55236 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RngttO55236 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RngttO55236 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RngttO55236 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RngttO55236 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RngttO55236 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RngttO55236 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RngttO55236 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RngttO55236 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RngttO55236 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RngttO55236 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RngttO55236 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RngttO55236 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RngttO55236 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RngttO55236 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
RngttO55236 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
RngttO55236 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
RngttO55236 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 143.8 ms