Protein–RNA interactions for Protein: O55028

Bckdk, [3-methyl-2-oxobutanoate dehydrogenase [lipoamide]] kinase, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BckdkO55028 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BckdkO55028 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BckdkO55028 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
BckdkO55028 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
BckdkO55028 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
BckdkO55028 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
BckdkO55028 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
BckdkO55028 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BckdkO55028 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
BckdkO55028 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
BckdkO55028 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
BckdkO55028 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
BckdkO55028 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
BckdkO55028 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
BckdkO55028 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
BckdkO55028 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
BckdkO55028 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
BckdkO55028 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BckdkO55028 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
BckdkO55028 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
BckdkO55028 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
BckdkO55028 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
BckdkO55028 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
BckdkO55028 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
BckdkO55028 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
BckdkO55028 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
BckdkO55028 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
BckdkO55028 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
BckdkO55028 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
BckdkO55028 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
BckdkO55028 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
BckdkO55028 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
BckdkO55028 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
BckdkO55028 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
BckdkO55028 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
BckdkO55028 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
BckdkO55028 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
BckdkO55028 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
BckdkO55028 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
BckdkO55028 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
BckdkO55028 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
BckdkO55028 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
BckdkO55028 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BckdkO55028 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BckdkO55028 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
BckdkO55028 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
BckdkO55028 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
BckdkO55028 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
BckdkO55028 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
BckdkO55028 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
BckdkO55028 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
BckdkO55028 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
BckdkO55028 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
BckdkO55028 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BckdkO55028 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
BckdkO55028 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BckdkO55028 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BckdkO55028 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
BckdkO55028 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
BckdkO55028 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BckdkO55028 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
BckdkO55028 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
BckdkO55028 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
BckdkO55028 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
BckdkO55028 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
BckdkO55028 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
BckdkO55028 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BckdkO55028 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BckdkO55028 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
BckdkO55028 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
BckdkO55028 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BckdkO55028 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BckdkO55028 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BckdkO55028 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BckdkO55028 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BckdkO55028 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BckdkO55028 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BckdkO55028 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BckdkO55028 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
BckdkO55028 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BckdkO55028 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BckdkO55028 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BckdkO55028 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
BckdkO55028 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
BckdkO55028 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
BckdkO55028 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BckdkO55028 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BckdkO55028 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
BckdkO55028 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BckdkO55028 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BckdkO55028 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BckdkO55028 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BckdkO55028 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BckdkO55028 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BckdkO55028 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
BckdkO55028 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BckdkO55028 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BckdkO55028 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
BckdkO55028 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
BckdkO55028 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms