Protein–RNA interactions for Protein: O54901

Cd200, OX-2 membrane glycoprotein, mousemouse

Predictions only

Length 278 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd200O54901 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cd200O54901 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cd200O54901 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cd200O54901 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cd200O54901 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cd200O54901 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cd200O54901 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cd200O54901 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cd200O54901 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cd200O54901 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cd200O54901 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Cd200O54901 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cd200O54901 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cd200O54901 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cd200O54901 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cd200O54901 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cd200O54901 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cd200O54901 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cd200O54901 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Cd200O54901 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cd200O54901 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cd200O54901 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Cd200O54901 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Cd200O54901 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cd200O54901 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cd200O54901 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cd200O54901 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cd200O54901 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cd200O54901 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cd200O54901 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cd200O54901 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cd200O54901 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cd200O54901 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cd200O54901 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cd200O54901 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cd200O54901 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cd200O54901 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cd200O54901 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cd200O54901 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cd200O54901 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cd200O54901 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cd200O54901 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cd200O54901 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Cd200O54901 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Cd200O54901 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cd200O54901 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cd200O54901 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cd200O54901 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cd200O54901 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Cd200O54901 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cd200O54901 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cd200O54901 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cd200O54901 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cd200O54901 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cd200O54901 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cd200O54901 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cd200O54901 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cd200O54901 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cd200O54901 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cd200O54901 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cd200O54901 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cd200O54901 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cd200O54901 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cd200O54901 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cd200O54901 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cd200O54901 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cd200O54901 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Cd200O54901 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cd200O54901 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cd200O54901 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cd200O54901 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cd200O54901 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cd200O54901 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cd200O54901 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cd200O54901 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Cd200O54901 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Cd200O54901 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Cd200O54901 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Cd200O54901 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Cd200O54901 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cd200O54901 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cd200O54901 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Cd200O54901 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Cd200O54901 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cd200O54901 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cd200O54901 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Cd200O54901 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Cd200O54901 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Cd200O54901 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Cd200O54901 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Cd200O54901 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Cd200O54901 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Cd200O54901 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Cd200O54901 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Cd200O54901 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Cd200O54901 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Cd200O54901 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Cd200O54901 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Cd200O54901 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Cd200O54901 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms