Protein–RNA interactions for Protein: O35912

Emp3, Epithelial membrane protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 163 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Emp3O35912 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Emp3O35912 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Emp3O35912 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Emp3O35912 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Emp3O35912 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Emp3O35912 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Emp3O35912 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Emp3O35912 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Emp3O35912 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Emp3O35912 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Emp3O35912 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Emp3O35912 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Emp3O35912 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Emp3O35912 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Emp3O35912 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Emp3O35912 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Emp3O35912 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Emp3O35912 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Emp3O35912 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Emp3O35912 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Emp3O35912 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Emp3O35912 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Emp3O35912 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Emp3O35912 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Emp3O35912 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Emp3O35912 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Emp3O35912 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Emp3O35912 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Emp3O35912 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Emp3O35912 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Emp3O35912 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Emp3O35912 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Emp3O35912 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Emp3O35912 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Emp3O35912 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Emp3O35912 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Emp3O35912 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Emp3O35912 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Emp3O35912 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Emp3O35912 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Emp3O35912 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Emp3O35912 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Emp3O35912 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Emp3O35912 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Emp3O35912 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Emp3O35912 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Emp3O35912 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Emp3O35912 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Emp3O35912 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Emp3O35912 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Emp3O35912 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Emp3O35912 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Emp3O35912 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Emp3O35912 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Emp3O35912 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Emp3O35912 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Emp3O35912 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Emp3O35912 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Emp3O35912 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Emp3O35912 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Emp3O35912 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Emp3O35912 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Emp3O35912 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Emp3O35912 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Emp3O35912 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Emp3O35912 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Emp3O35912 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Emp3O35912 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Emp3O35912 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Emp3O35912 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Emp3O35912 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Emp3O35912 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Emp3O35912 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Emp3O35912 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Emp3O35912 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Emp3O35912 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Emp3O35912 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Emp3O35912 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Emp3O35912 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Emp3O35912 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Emp3O35912 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Emp3O35912 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Emp3O35912 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Emp3O35912 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Emp3O35912 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Emp3O35912 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Emp3O35912 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Emp3O35912 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Emp3O35912 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Emp3O35912 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Emp3O35912 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Emp3O35912 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Emp3O35912 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Emp3O35912 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Emp3O35912 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Emp3O35912 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Emp3O35912 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Emp3O35912 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Emp3O35912 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Emp3O35912 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.4 ms