Protein–RNA interactions for Protein: O35426

Xbp1, X-box-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xbp1O35426 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Xbp1O35426 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Xbp1O35426 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Xbp1O35426 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Xbp1O35426 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Xbp1O35426 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Xbp1O35426 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Xbp1O35426 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Xbp1O35426 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Xbp1O35426 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Xbp1O35426 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Xbp1O35426 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Xbp1O35426 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Xbp1O35426 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Xbp1O35426 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Xbp1O35426 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Xbp1O35426 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Xbp1O35426 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Xbp1O35426 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Xbp1O35426 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Xbp1O35426 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Xbp1O35426 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Xbp1O35426 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Xbp1O35426 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Xbp1O35426 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Xbp1O35426 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Xbp1O35426 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Xbp1O35426 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Xbp1O35426 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Xbp1O35426 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Xbp1O35426 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Xbp1O35426 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Xbp1O35426 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Xbp1O35426 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Xbp1O35426 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Xbp1O35426 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Xbp1O35426 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Xbp1O35426 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Xbp1O35426 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Xbp1O35426 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Xbp1O35426 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Xbp1O35426 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Xbp1O35426 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Xbp1O35426 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Xbp1O35426 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Xbp1O35426 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Xbp1O35426 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Xbp1O35426 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Xbp1O35426 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Xbp1O35426 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Xbp1O35426 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Xbp1O35426 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Xbp1O35426 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Xbp1O35426 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Xbp1O35426 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Xbp1O35426 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Xbp1O35426 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Xbp1O35426 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Xbp1O35426 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Xbp1O35426 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Xbp1O35426 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Xbp1O35426 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Xbp1O35426 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Xbp1O35426 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Xbp1O35426 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Xbp1O35426 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Xbp1O35426 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Xbp1O35426 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Xbp1O35426 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Xbp1O35426 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Xbp1O35426 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Xbp1O35426 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Xbp1O35426 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Xbp1O35426 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Xbp1O35426 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Xbp1O35426 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Xbp1O35426 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Xbp1O35426 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Xbp1O35426 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Xbp1O35426 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Xbp1O35426 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Xbp1O35426 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Xbp1O35426 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Xbp1O35426 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Xbp1O35426 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Xbp1O35426 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Xbp1O35426 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Xbp1O35426 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Xbp1O35426 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Xbp1O35426 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Xbp1O35426 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Xbp1O35426 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Xbp1O35426 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Xbp1O35426 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Xbp1O35426 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Xbp1O35426 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Xbp1O35426 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Xbp1O35426 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Xbp1O35426 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Xbp1O35426 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.5 ms