Protein–RNA interactions for Protein: O35350

Capn1, Calpain-1 catalytic subunit, mousemouse

Predictions only

Length 713 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn1O35350 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Capn1O35350 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Capn1O35350 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Capn1O35350 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Capn1O35350 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Capn1O35350 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Capn1O35350 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Capn1O35350 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Capn1O35350 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Capn1O35350 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Capn1O35350 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Capn1O35350 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Capn1O35350 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Capn1O35350 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Capn1O35350 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Capn1O35350 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Capn1O35350 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Capn1O35350 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Capn1O35350 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Capn1O35350 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Capn1O35350 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Capn1O35350 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Capn1O35350 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Capn1O35350 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Capn1O35350 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Capn1O35350 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Capn1O35350 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Capn1O35350 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Capn1O35350 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Capn1O35350 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Capn1O35350 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Capn1O35350 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Capn1O35350 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Capn1O35350 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Capn1O35350 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Capn1O35350 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Capn1O35350 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Capn1O35350 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Capn1O35350 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Capn1O35350 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Capn1O35350 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Capn1O35350 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Capn1O35350 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Capn1O35350 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Capn1O35350 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Capn1O35350 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Capn1O35350 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Capn1O35350 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Capn1O35350 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Capn1O35350 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Capn1O35350 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Capn1O35350 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Capn1O35350 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Capn1O35350 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Capn1O35350 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Capn1O35350 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Capn1O35350 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Capn1O35350 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Capn1O35350 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Capn1O35350 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Capn1O35350 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Capn1O35350 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Capn1O35350 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Capn1O35350 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Capn1O35350 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Capn1O35350 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Capn1O35350 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Capn1O35350 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Capn1O35350 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Capn1O35350 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Capn1O35350 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Capn1O35350 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Capn1O35350 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Capn1O35350 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Capn1O35350 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Capn1O35350 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Capn1O35350 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Capn1O35350 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Capn1O35350 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Capn1O35350 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Capn1O35350 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Capn1O35350 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Capn1O35350 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Capn1O35350 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Capn1O35350 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Capn1O35350 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Capn1O35350 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Capn1O35350 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Capn1O35350 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Capn1O35350 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Capn1O35350 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Capn1O35350 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Capn1O35350 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Capn1O35350 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Capn1O35350 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Capn1O35350 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Capn1O35350 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Capn1O35350 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Capn1O35350 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Capn1O35350 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms