Protein–RNA interactions for Protein: O35343

Kpna4, Importin subunit alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 521 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kpna4O35343 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Kpna4O35343 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Kpna4O35343 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Kpna4O35343 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Kpna4O35343 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Kpna4O35343 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Kpna4O35343 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Kpna4O35343 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Kpna4O35343 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Kpna4O35343 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Kpna4O35343 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Kpna4O35343 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Kpna4O35343 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Kpna4O35343 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Kpna4O35343 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Kpna4O35343 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Kpna4O35343 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Kpna4O35343 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Kpna4O35343 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Kpna4O35343 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Kpna4O35343 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Kpna4O35343 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Kpna4O35343 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Kpna4O35343 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Kpna4O35343 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Kpna4O35343 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Kpna4O35343 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Kpna4O35343 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Kpna4O35343 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Kpna4O35343 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Kpna4O35343 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Kpna4O35343 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Kpna4O35343 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Kpna4O35343 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Kpna4O35343 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Kpna4O35343 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Kpna4O35343 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Kpna4O35343 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Kpna4O35343 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Kpna4O35343 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Kpna4O35343 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Kpna4O35343 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Kpna4O35343 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Kpna4O35343 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Kpna4O35343 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Kpna4O35343 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Kpna4O35343 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Kpna4O35343 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Kpna4O35343 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Kpna4O35343 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Kpna4O35343 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Kpna4O35343 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Kpna4O35343 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Kpna4O35343 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Kpna4O35343 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Kpna4O35343 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Kpna4O35343 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Kpna4O35343 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Kpna4O35343 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Kpna4O35343 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Kpna4O35343 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Kpna4O35343 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Kpna4O35343 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Kpna4O35343 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Kpna4O35343 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Kpna4O35343 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Kpna4O35343 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Kpna4O35343 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Kpna4O35343 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Kpna4O35343 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Kpna4O35343 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Kpna4O35343 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Kpna4O35343 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Kpna4O35343 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Kpna4O35343 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Kpna4O35343 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Kpna4O35343 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Kpna4O35343 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Kpna4O35343 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Kpna4O35343 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Kpna4O35343 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Kpna4O35343 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Kpna4O35343 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Kpna4O35343 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Kpna4O35343 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Kpna4O35343 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Kpna4O35343 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Kpna4O35343 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Kpna4O35343 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Kpna4O35343 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Kpna4O35343 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Kpna4O35343 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Kpna4O35343 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Kpna4O35343 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Kpna4O35343 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Kpna4O35343 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Kpna4O35343 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Kpna4O35343 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Kpna4O35343 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Kpna4O35343 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.9 ms