Protein–RNA interactions for Protein: O35173

Kcns1, Potassium voltage-gated channel subfamily S member 1, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcns1O35173 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Kcns1O35173 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Kcns1O35173 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Kcns1O35173 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Kcns1O35173 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Kcns1O35173 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Kcns1O35173 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Kcns1O35173 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Kcns1O35173 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Kcns1O35173 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Kcns1O35173 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Kcns1O35173 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Kcns1O35173 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Kcns1O35173 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Kcns1O35173 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Kcns1O35173 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Kcns1O35173 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Kcns1O35173 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Kcns1O35173 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Kcns1O35173 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Kcns1O35173 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Kcns1O35173 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Kcns1O35173 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Kcns1O35173 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Kcns1O35173 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Kcns1O35173 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Kcns1O35173 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Kcns1O35173 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Kcns1O35173 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Kcns1O35173 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Kcns1O35173 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Kcns1O35173 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Kcns1O35173 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Kcns1O35173 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Kcns1O35173 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Kcns1O35173 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Kcns1O35173 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Kcns1O35173 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Kcns1O35173 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Kcns1O35173 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Kcns1O35173 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Kcns1O35173 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Kcns1O35173 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Kcns1O35173 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Kcns1O35173 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Kcns1O35173 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Kcns1O35173 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Kcns1O35173 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Kcns1O35173 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Kcns1O35173 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Kcns1O35173 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Kcns1O35173 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Kcns1O35173 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Kcns1O35173 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Kcns1O35173 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Kcns1O35173 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Kcns1O35173 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Kcns1O35173 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Kcns1O35173 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Kcns1O35173 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Kcns1O35173 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Kcns1O35173 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Kcns1O35173 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Kcns1O35173 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Kcns1O35173 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Kcns1O35173 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Kcns1O35173 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Kcns1O35173 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Kcns1O35173 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Kcns1O35173 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Kcns1O35173 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Kcns1O35173 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Kcns1O35173 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Kcns1O35173 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Kcns1O35173 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Kcns1O35173 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Kcns1O35173 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Kcns1O35173 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC21.31■■□□□ 1
Kcns1O35173 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Kcns1O35173 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Kcns1O35173 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Kcns1O35173 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Kcns1O35173 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Kcns1O35173 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Kcns1O35173 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.3■■□□□ 1
Kcns1O35173 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Kcns1O35173 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Kcns1O35173 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Kcns1O35173 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Kcns1O35173 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Kcns1O35173 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Kcns1O35173 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Kcns1O35173 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Kcns1O35173 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Kcns1O35173 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Kcns1O35173 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Kcns1O35173 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Kcns1O35173 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Kcns1O35173 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Kcns1O35173 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
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