Protein–RNA interactions for Protein: O09117

Sypl1, Synaptophysin-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sypl1O09117 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Sypl1O09117 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Sypl1O09117 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Sypl1O09117 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Sypl1O09117 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Sypl1O09117 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Sypl1O09117 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Sypl1O09117 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Sypl1O09117 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Sypl1O09117 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Sypl1O09117 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Sypl1O09117 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Sypl1O09117 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Sypl1O09117 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Sypl1O09117 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Sypl1O09117 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Sypl1O09117 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Sypl1O09117 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Sypl1O09117 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Sypl1O09117 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Sypl1O09117 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Sypl1O09117 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Sypl1O09117 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Sypl1O09117 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Sypl1O09117 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Sypl1O09117 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Sypl1O09117 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Sypl1O09117 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Sypl1O09117 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Sypl1O09117 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Sypl1O09117 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Sypl1O09117 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Sypl1O09117 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Sypl1O09117 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Sypl1O09117 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Sypl1O09117 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Sypl1O09117 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Sypl1O09117 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Sypl1O09117 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Sypl1O09117 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Sypl1O09117 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Sypl1O09117 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Sypl1O09117 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Sypl1O09117 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Sypl1O09117 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Sypl1O09117 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Sypl1O09117 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Sypl1O09117 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Sypl1O09117 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Sypl1O09117 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Sypl1O09117 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Sypl1O09117 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Sypl1O09117 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Sypl1O09117 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Sypl1O09117 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Sypl1O09117 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Sypl1O09117 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Sypl1O09117 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Sypl1O09117 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Sypl1O09117 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Sypl1O09117 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Sypl1O09117 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Sypl1O09117 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Sypl1O09117 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Sypl1O09117 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Sypl1O09117 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Sypl1O09117 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Sypl1O09117 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Sypl1O09117 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Sypl1O09117 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Sypl1O09117 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Sypl1O09117 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Sypl1O09117 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Sypl1O09117 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Sypl1O09117 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Sypl1O09117 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Sypl1O09117 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Sypl1O09117 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Sypl1O09117 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Sypl1O09117 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Sypl1O09117 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Sypl1O09117 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Sypl1O09117 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Sypl1O09117 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Sypl1O09117 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Sypl1O09117 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Sypl1O09117 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Sypl1O09117 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Sypl1O09117 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Sypl1O09117 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Sypl1O09117 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Sypl1O09117 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Sypl1O09117 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Sypl1O09117 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Sypl1O09117 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Sypl1O09117 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Sypl1O09117 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Sypl1O09117 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Sypl1O09117 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Sypl1O09117 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.8 ms