Protein–RNA interactions for Protein: O09105

Neurod4, Neurogenic differentiation factor 4, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Neurod4O09105 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Neurod4O09105 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Neurod4O09105 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Neurod4O09105 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Neurod4O09105 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Neurod4O09105 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Neurod4O09105 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Neurod4O09105 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Neurod4O09105 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Neurod4O09105 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Neurod4O09105 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Neurod4O09105 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Neurod4O09105 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Neurod4O09105 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Neurod4O09105 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Neurod4O09105 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Neurod4O09105 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Neurod4O09105 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Neurod4O09105 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Neurod4O09105 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Neurod4O09105 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Neurod4O09105 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Neurod4O09105 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Neurod4O09105 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Neurod4O09105 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Neurod4O09105 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Neurod4O09105 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Neurod4O09105 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Neurod4O09105 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Neurod4O09105 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Neurod4O09105 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Neurod4O09105 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Neurod4O09105 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Neurod4O09105 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Neurod4O09105 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Neurod4O09105 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Neurod4O09105 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Neurod4O09105 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Neurod4O09105 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Neurod4O09105 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Neurod4O09105 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Neurod4O09105 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Neurod4O09105 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Neurod4O09105 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Neurod4O09105 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Neurod4O09105 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Neurod4O09105 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Neurod4O09105 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Neurod4O09105 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Neurod4O09105 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Neurod4O09105 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Neurod4O09105 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Neurod4O09105 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Neurod4O09105 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Neurod4O09105 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Neurod4O09105 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Neurod4O09105 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Neurod4O09105 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Neurod4O09105 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Neurod4O09105 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Neurod4O09105 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Neurod4O09105 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Neurod4O09105 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Neurod4O09105 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Neurod4O09105 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Neurod4O09105 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Neurod4O09105 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Neurod4O09105 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Neurod4O09105 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Neurod4O09105 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Neurod4O09105 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Neurod4O09105 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Neurod4O09105 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Neurod4O09105 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Neurod4O09105 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Neurod4O09105 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Neurod4O09105 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Neurod4O09105 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Neurod4O09105 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Neurod4O09105 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Neurod4O09105 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Neurod4O09105 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Neurod4O09105 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Neurod4O09105 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Neurod4O09105 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Neurod4O09105 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Neurod4O09105 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Neurod4O09105 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Neurod4O09105 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Neurod4O09105 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Neurod4O09105 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Neurod4O09105 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Neurod4O09105 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Neurod4O09105 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Neurod4O09105 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Neurod4O09105 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Neurod4O09105 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Neurod4O09105 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Neurod4O09105 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Neurod4O09105 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.7 ms