Protein–RNA interactions for Protein: O08692

Ngp, Neutrophilic granule protein, mousemouse

Predictions only

Length 167 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NgpO08692 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NgpO08692 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NgpO08692 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NgpO08692 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NgpO08692 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NgpO08692 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NgpO08692 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NgpO08692 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NgpO08692 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NgpO08692 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NgpO08692 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NgpO08692 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NgpO08692 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NgpO08692 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
NgpO08692 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NgpO08692 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NgpO08692 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NgpO08692 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NgpO08692 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NgpO08692 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NgpO08692 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NgpO08692 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NgpO08692 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NgpO08692 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NgpO08692 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NgpO08692 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NgpO08692 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NgpO08692 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NgpO08692 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NgpO08692 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NgpO08692 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NgpO08692 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NgpO08692 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NgpO08692 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NgpO08692 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NgpO08692 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NgpO08692 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NgpO08692 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NgpO08692 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NgpO08692 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NgpO08692 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NgpO08692 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NgpO08692 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NgpO08692 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NgpO08692 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NgpO08692 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NgpO08692 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NgpO08692 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NgpO08692 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NgpO08692 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
NgpO08692 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
NgpO08692 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NgpO08692 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NgpO08692 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NgpO08692 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NgpO08692 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NgpO08692 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NgpO08692 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NgpO08692 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NgpO08692 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NgpO08692 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NgpO08692 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NgpO08692 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NgpO08692 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NgpO08692 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NgpO08692 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NgpO08692 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NgpO08692 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NgpO08692 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NgpO08692 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NgpO08692 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NgpO08692 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NgpO08692 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NgpO08692 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NgpO08692 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NgpO08692 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NgpO08692 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NgpO08692 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NgpO08692 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NgpO08692 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
NgpO08692 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NgpO08692 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC22■■□□□ 1.11
NgpO08692 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC22■■□□□ 1.11
NgpO08692 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
NgpO08692 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NgpO08692 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
NgpO08692 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NgpO08692 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NgpO08692 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NgpO08692 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NgpO08692 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NgpO08692 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NgpO08692 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NgpO08692 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NgpO08692 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NgpO08692 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NgpO08692 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NgpO08692 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NgpO08692 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NgpO08692 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms