Protein–RNA interactions for Protein: J3QNQ5

Btbd35f24, BTB domain-containing 35, family member 24, mousemouse

Predictions only

Length 498 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Btbd35f24J3QNQ5 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Btbd35f24J3QNQ5 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Btbd35f24J3QNQ5 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Btbd35f24J3QNQ5 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Btbd35f24J3QNQ5 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Btbd35f24J3QNQ5 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Btbd35f24J3QNQ5 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Btbd35f24J3QNQ5 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Btbd35f24J3QNQ5 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Btbd35f24J3QNQ5 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Btbd35f24J3QNQ5 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Btbd35f24J3QNQ5 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Btbd35f24J3QNQ5 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Btbd35f24J3QNQ5 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Btbd35f24J3QNQ5 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Btbd35f24J3QNQ5 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Btbd35f24J3QNQ5 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Btbd35f24J3QNQ5 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Btbd35f24J3QNQ5 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Btbd35f24J3QNQ5 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Btbd35f24J3QNQ5 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Btbd35f24J3QNQ5 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Btbd35f24J3QNQ5 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Btbd35f24J3QNQ5 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Btbd35f24J3QNQ5 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Btbd35f24J3QNQ5 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Btbd35f24J3QNQ5 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Btbd35f24J3QNQ5 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Btbd35f24J3QNQ5 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Btbd35f24J3QNQ5 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Btbd35f24J3QNQ5 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Btbd35f24J3QNQ5 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Btbd35f24J3QNQ5 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Btbd35f24J3QNQ5 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Btbd35f24J3QNQ5 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Btbd35f24J3QNQ5 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Btbd35f24J3QNQ5 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Btbd35f24J3QNQ5 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Btbd35f24J3QNQ5 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Btbd35f24J3QNQ5 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Btbd35f24J3QNQ5 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Btbd35f24J3QNQ5 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Btbd35f24J3QNQ5 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Btbd35f24J3QNQ5 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Btbd35f24J3QNQ5 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Btbd35f24J3QNQ5 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Btbd35f24J3QNQ5 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Btbd35f24J3QNQ5 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Btbd35f24J3QNQ5 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Btbd35f24J3QNQ5 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Btbd35f24J3QNQ5 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Btbd35f24J3QNQ5 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Btbd35f24J3QNQ5 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Btbd35f24J3QNQ5 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Btbd35f24J3QNQ5 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Btbd35f24J3QNQ5 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Btbd35f24J3QNQ5 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Btbd35f24J3QNQ5 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Btbd35f24J3QNQ5 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Btbd35f24J3QNQ5 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Btbd35f24J3QNQ5 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Btbd35f24J3QNQ5 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Btbd35f24J3QNQ5 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Btbd35f24J3QNQ5 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Btbd35f24J3QNQ5 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Btbd35f24J3QNQ5 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Btbd35f24J3QNQ5 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Btbd35f24J3QNQ5 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Btbd35f24J3QNQ5 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Btbd35f24J3QNQ5 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Btbd35f24J3QNQ5 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Btbd35f24J3QNQ5 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Btbd35f24J3QNQ5 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Btbd35f24J3QNQ5 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Btbd35f24J3QNQ5 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Btbd35f24J3QNQ5 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Btbd35f24J3QNQ5 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Btbd35f24J3QNQ5 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Btbd35f24J3QNQ5 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Btbd35f24J3QNQ5 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Btbd35f24J3QNQ5 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Btbd35f24J3QNQ5 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Btbd35f24J3QNQ5 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Btbd35f24J3QNQ5 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Btbd35f24J3QNQ5 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Btbd35f24J3QNQ5 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Btbd35f24J3QNQ5 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Btbd35f24J3QNQ5 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Btbd35f24J3QNQ5 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Btbd35f24J3QNQ5 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Btbd35f24J3QNQ5 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Btbd35f24J3QNQ5 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Btbd35f24J3QNQ5 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Btbd35f24J3QNQ5 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Btbd35f24J3QNQ5 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Btbd35f24J3QNQ5 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Btbd35f24J3QNQ5 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Btbd35f24J3QNQ5 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Btbd35f24J3QNQ5 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Btbd35f24J3QNQ5 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms