Protein–RNA interactions for Protein: J3QNP2

Smim18, Small integral membrane protein 18, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim18J3QNP2 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Smim18J3QNP2 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Smim18J3QNP2 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Smim18J3QNP2 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Smim18J3QNP2 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Smim18J3QNP2 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Smim18J3QNP2 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Smim18J3QNP2 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Smim18J3QNP2 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Smim18J3QNP2 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Smim18J3QNP2 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Smim18J3QNP2 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Smim18J3QNP2 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Smim18J3QNP2 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Smim18J3QNP2 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Smim18J3QNP2 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Smim18J3QNP2 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Smim18J3QNP2 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Smim18J3QNP2 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Smim18J3QNP2 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Smim18J3QNP2 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Smim18J3QNP2 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Smim18J3QNP2 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Smim18J3QNP2 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Smim18J3QNP2 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Smim18J3QNP2 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Smim18J3QNP2 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Smim18J3QNP2 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Smim18J3QNP2 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Smim18J3QNP2 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Smim18J3QNP2 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Smim18J3QNP2 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Smim18J3QNP2 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Smim18J3QNP2 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Smim18J3QNP2 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Smim18J3QNP2 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Smim18J3QNP2 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Smim18J3QNP2 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Smim18J3QNP2 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Smim18J3QNP2 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Smim18J3QNP2 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Smim18J3QNP2 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Smim18J3QNP2 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Smim18J3QNP2 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Smim18J3QNP2 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Smim18J3QNP2 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Smim18J3QNP2 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Smim18J3QNP2 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Smim18J3QNP2 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Smim18J3QNP2 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Smim18J3QNP2 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Smim18J3QNP2 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Smim18J3QNP2 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Smim18J3QNP2 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Smim18J3QNP2 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Smim18J3QNP2 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Smim18J3QNP2 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Smim18J3QNP2 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Smim18J3QNP2 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Smim18J3QNP2 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Smim18J3QNP2 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Smim18J3QNP2 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Smim18J3QNP2 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Smim18J3QNP2 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Smim18J3QNP2 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Smim18J3QNP2 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Smim18J3QNP2 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Smim18J3QNP2 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Smim18J3QNP2 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Smim18J3QNP2 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Smim18J3QNP2 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Smim18J3QNP2 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Smim18J3QNP2 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Smim18J3QNP2 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Smim18J3QNP2 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Smim18J3QNP2 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Smim18J3QNP2 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Smim18J3QNP2 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Smim18J3QNP2 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Smim18J3QNP2 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Smim18J3QNP2 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Smim18J3QNP2 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Smim18J3QNP2 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Smim18J3QNP2 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Smim18J3QNP2 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Smim18J3QNP2 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Smim18J3QNP2 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Smim18J3QNP2 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Smim18J3QNP2 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Smim18J3QNP2 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Smim18J3QNP2 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Smim18J3QNP2 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Smim18J3QNP2 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Smim18J3QNP2 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Smim18J3QNP2 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Smim18J3QNP2 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Smim18J3QNP2 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Smim18J3QNP2 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Smim18J3QNP2 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Smim18J3QNP2 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.6 ms