Protein–RNA interactions for Protein: J3QJU9

Gm21886, Predicted gene, 21886, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21886J3QJU9 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Gm21886J3QJU9 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm21886J3QJU9 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Gm21886J3QJU9 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm21886J3QJU9 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm21886J3QJU9 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm21886J3QJU9 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Gm21886J3QJU9 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm21886J3QJU9 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm21886J3QJU9 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm21886J3QJU9 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm21886J3QJU9 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm21886J3QJU9 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm21886J3QJU9 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm21886J3QJU9 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm21886J3QJU9 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Gm21886J3QJU9 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm21886J3QJU9 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm21886J3QJU9 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm21886J3QJU9 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm21886J3QJU9 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm21886J3QJU9 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm21886J3QJU9 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm21886J3QJU9 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm21886J3QJU9 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm21886J3QJU9 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm21886J3QJU9 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm21886J3QJU9 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm21886J3QJU9 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm21886J3QJU9 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm21886J3QJU9 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm21886J3QJU9 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm21886J3QJU9 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm21886J3QJU9 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm21886J3QJU9 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm21886J3QJU9 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Gm21886J3QJU9 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm21886J3QJU9 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm21886J3QJU9 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm21886J3QJU9 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm21886J3QJU9 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm21886J3QJU9 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm21886J3QJU9 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm21886J3QJU9 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm21886J3QJU9 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm21886J3QJU9 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Gm21886J3QJU9 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
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Gm21886J3QJU9 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm21886J3QJU9 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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Gm21886J3QJU9 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm21886J3QJU9 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm21886J3QJU9 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm21886J3QJU9 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm21886J3QJU9 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
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Gm21886J3QJU9 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm21886J3QJU9 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm21886J3QJU9 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm21886J3QJU9 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm21886J3QJU9 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm21886J3QJU9 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm21886J3QJU9 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm21886J3QJU9 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm21886J3QJU9 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm21886J3QJU9 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm21886J3QJU9 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm21886J3QJU9 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm21886J3QJU9 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm21886J3QJU9 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm21886J3QJU9 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm21886J3QJU9 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm21886J3QJU9 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm21886J3QJU9 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm21886J3QJU9 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm21886J3QJU9 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm21886J3QJU9 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm21886J3QJU9 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm21886J3QJU9 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm21886J3QJU9 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
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