Protein–RNA interactions for Protein: G5E8X2

Pabpc4l, MCG12357, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pabpc4lG5E8X2 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Pabpc4lG5E8X2 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Pabpc4lG5E8X2 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Pabpc4lG5E8X2 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Pabpc4lG5E8X2 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Pabpc4lG5E8X2 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Pabpc4lG5E8X2 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Pabpc4lG5E8X2 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Pabpc4lG5E8X2 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Pabpc4lG5E8X2 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Pabpc4lG5E8X2 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Pabpc4lG5E8X2 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Pabpc4lG5E8X2 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Pabpc4lG5E8X2 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Pabpc4lG5E8X2 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Pabpc4lG5E8X2 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Pabpc4lG5E8X2 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Pabpc4lG5E8X2 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Pabpc4lG5E8X2 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Pabpc4lG5E8X2 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Pabpc4lG5E8X2 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Pabpc4lG5E8X2 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Pabpc4lG5E8X2 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Pabpc4lG5E8X2 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Pabpc4lG5E8X2 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Pabpc4lG5E8X2 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Pabpc4lG5E8X2 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Pabpc4lG5E8X2 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Pabpc4lG5E8X2 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Pabpc4lG5E8X2 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Pabpc4lG5E8X2 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Pabpc4lG5E8X2 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Pabpc4lG5E8X2 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Pabpc4lG5E8X2 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Pabpc4lG5E8X2 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Pabpc4lG5E8X2 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Pabpc4lG5E8X2 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Pabpc4lG5E8X2 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Pabpc4lG5E8X2 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Pabpc4lG5E8X2 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Pabpc4lG5E8X2 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Pabpc4lG5E8X2 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Pabpc4lG5E8X2 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Pabpc4lG5E8X2 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Pabpc4lG5E8X2 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Pabpc4lG5E8X2 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Pabpc4lG5E8X2 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Pabpc4lG5E8X2 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Pabpc4lG5E8X2 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Pabpc4lG5E8X2 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Pabpc4lG5E8X2 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Pabpc4lG5E8X2 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Pabpc4lG5E8X2 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Pabpc4lG5E8X2 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Pabpc4lG5E8X2 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Pabpc4lG5E8X2 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Pabpc4lG5E8X2 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Pabpc4lG5E8X2 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Pabpc4lG5E8X2 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Pabpc4lG5E8X2 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Pabpc4lG5E8X2 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Pabpc4lG5E8X2 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Pabpc4lG5E8X2 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Pabpc4lG5E8X2 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Pabpc4lG5E8X2 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Pabpc4lG5E8X2 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Pabpc4lG5E8X2 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Pabpc4lG5E8X2 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Pabpc4lG5E8X2 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Pabpc4lG5E8X2 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Pabpc4lG5E8X2 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Pabpc4lG5E8X2 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Pabpc4lG5E8X2 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Pabpc4lG5E8X2 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Pabpc4lG5E8X2 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Pabpc4lG5E8X2 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Pabpc4lG5E8X2 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Pabpc4lG5E8X2 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Pabpc4lG5E8X2 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Pabpc4lG5E8X2 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Pabpc4lG5E8X2 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Pabpc4lG5E8X2 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Pabpc4lG5E8X2 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Pabpc4lG5E8X2 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Pabpc4lG5E8X2 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Pabpc4lG5E8X2 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Pabpc4lG5E8X2 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Pabpc4lG5E8X2 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Pabpc4lG5E8X2 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Pabpc4lG5E8X2 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Pabpc4lG5E8X2 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Pabpc4lG5E8X2 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Pabpc4lG5E8X2 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Pabpc4lG5E8X2 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Pabpc4lG5E8X2 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Pabpc4lG5E8X2 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Pabpc4lG5E8X2 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Pabpc4lG5E8X2 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Pabpc4lG5E8X2 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Pabpc4lG5E8X2 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.3 ms