Protein–RNA interactions for Protein: G3X9C2

Nccrp1, F-box only protein 50, mousemouse

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nccrp1G3X9C2 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Nccrp1G3X9C2 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Nccrp1G3X9C2 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Nccrp1G3X9C2 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Nccrp1G3X9C2 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Nccrp1G3X9C2 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Nccrp1G3X9C2 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Nccrp1G3X9C2 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Nccrp1G3X9C2 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Nccrp1G3X9C2 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Nccrp1G3X9C2 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Nccrp1G3X9C2 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Nccrp1G3X9C2 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Nccrp1G3X9C2 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Nccrp1G3X9C2 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Nccrp1G3X9C2 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Nccrp1G3X9C2 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Nccrp1G3X9C2 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Nccrp1G3X9C2 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Nccrp1G3X9C2 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Nccrp1G3X9C2 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Nccrp1G3X9C2 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Nccrp1G3X9C2 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Nccrp1G3X9C2 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Nccrp1G3X9C2 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Nccrp1G3X9C2 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Nccrp1G3X9C2 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Nccrp1G3X9C2 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Nccrp1G3X9C2 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Nccrp1G3X9C2 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Nccrp1G3X9C2 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Nccrp1G3X9C2 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Nccrp1G3X9C2 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Nccrp1G3X9C2 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Nccrp1G3X9C2 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Nccrp1G3X9C2 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Nccrp1G3X9C2 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Nccrp1G3X9C2 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Nccrp1G3X9C2 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Nccrp1G3X9C2 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Nccrp1G3X9C2 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Nccrp1G3X9C2 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Nccrp1G3X9C2 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Nccrp1G3X9C2 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Nccrp1G3X9C2 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Nccrp1G3X9C2 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Nccrp1G3X9C2 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Nccrp1G3X9C2 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Nccrp1G3X9C2 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Nccrp1G3X9C2 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Nccrp1G3X9C2 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Nccrp1G3X9C2 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Nccrp1G3X9C2 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Nccrp1G3X9C2 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Nccrp1G3X9C2 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Nccrp1G3X9C2 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Nccrp1G3X9C2 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Nccrp1G3X9C2 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Nccrp1G3X9C2 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Nccrp1G3X9C2 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Nccrp1G3X9C2 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Nccrp1G3X9C2 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Nccrp1G3X9C2 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Nccrp1G3X9C2 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Nccrp1G3X9C2 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Nccrp1G3X9C2 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Nccrp1G3X9C2 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Nccrp1G3X9C2 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Nccrp1G3X9C2 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Nccrp1G3X9C2 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Nccrp1G3X9C2 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Nccrp1G3X9C2 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Nccrp1G3X9C2 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Nccrp1G3X9C2 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Nccrp1G3X9C2 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Nccrp1G3X9C2 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Nccrp1G3X9C2 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Nccrp1G3X9C2 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Nccrp1G3X9C2 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Nccrp1G3X9C2 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Nccrp1G3X9C2 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Nccrp1G3X9C2 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Nccrp1G3X9C2 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Nccrp1G3X9C2 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Nccrp1G3X9C2 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Nccrp1G3X9C2 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Nccrp1G3X9C2 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Nccrp1G3X9C2 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Nccrp1G3X9C2 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Nccrp1G3X9C2 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Nccrp1G3X9C2 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Nccrp1G3X9C2 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Nccrp1G3X9C2 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Nccrp1G3X9C2 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Nccrp1G3X9C2 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Nccrp1G3X9C2 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Nccrp1G3X9C2 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Nccrp1G3X9C2 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Nccrp1G3X9C2 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Nccrp1G3X9C2 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.7 ms