Protein–RNA interactions for Protein: F8VQM8

Xntrpc, Xndc1-transient receptor potential cation channel, subfamily C, member 2 readthrough, mousemouse

Predictions only

Length 1,264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XntrpcF8VQM8 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
XntrpcF8VQM8 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
XntrpcF8VQM8 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
XntrpcF8VQM8 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
XntrpcF8VQM8 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
XntrpcF8VQM8 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
XntrpcF8VQM8 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
XntrpcF8VQM8 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
XntrpcF8VQM8 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
XntrpcF8VQM8 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
XntrpcF8VQM8 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
XntrpcF8VQM8 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
XntrpcF8VQM8 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
XntrpcF8VQM8 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
XntrpcF8VQM8 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
XntrpcF8VQM8 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
XntrpcF8VQM8 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
XntrpcF8VQM8 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
XntrpcF8VQM8 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
XntrpcF8VQM8 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
XntrpcF8VQM8 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
XntrpcF8VQM8 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
XntrpcF8VQM8 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
XntrpcF8VQM8 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
XntrpcF8VQM8 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
XntrpcF8VQM8 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
XntrpcF8VQM8 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
XntrpcF8VQM8 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
XntrpcF8VQM8 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
XntrpcF8VQM8 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
XntrpcF8VQM8 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
XntrpcF8VQM8 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
XntrpcF8VQM8 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
XntrpcF8VQM8 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
XntrpcF8VQM8 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
XntrpcF8VQM8 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
XntrpcF8VQM8 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
XntrpcF8VQM8 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
XntrpcF8VQM8 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
XntrpcF8VQM8 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
XntrpcF8VQM8 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
XntrpcF8VQM8 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
XntrpcF8VQM8 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
XntrpcF8VQM8 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
XntrpcF8VQM8 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
XntrpcF8VQM8 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
XntrpcF8VQM8 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
XntrpcF8VQM8 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
XntrpcF8VQM8 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
XntrpcF8VQM8 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
XntrpcF8VQM8 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
XntrpcF8VQM8 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
XntrpcF8VQM8 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
XntrpcF8VQM8 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
XntrpcF8VQM8 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
XntrpcF8VQM8 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
XntrpcF8VQM8 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
XntrpcF8VQM8 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
XntrpcF8VQM8 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
XntrpcF8VQM8 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
XntrpcF8VQM8 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
XntrpcF8VQM8 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
XntrpcF8VQM8 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
XntrpcF8VQM8 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
XntrpcF8VQM8 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
XntrpcF8VQM8 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
XntrpcF8VQM8 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC25.7■■□□□ 1.71
XntrpcF8VQM8 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
XntrpcF8VQM8 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
XntrpcF8VQM8 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
XntrpcF8VQM8 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
XntrpcF8VQM8 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
XntrpcF8VQM8 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
XntrpcF8VQM8 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
XntrpcF8VQM8 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
XntrpcF8VQM8 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
XntrpcF8VQM8 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
XntrpcF8VQM8 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
XntrpcF8VQM8 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
XntrpcF8VQM8 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
XntrpcF8VQM8 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
XntrpcF8VQM8 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
XntrpcF8VQM8 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
XntrpcF8VQM8 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
XntrpcF8VQM8 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
XntrpcF8VQM8 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
XntrpcF8VQM8 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
XntrpcF8VQM8 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
XntrpcF8VQM8 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
XntrpcF8VQM8 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
XntrpcF8VQM8 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
XntrpcF8VQM8 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
XntrpcF8VQM8 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
XntrpcF8VQM8 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
XntrpcF8VQM8 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
XntrpcF8VQM8 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
XntrpcF8VQM8 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
XntrpcF8VQM8 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
XntrpcF8VQM8 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
XntrpcF8VQM8 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms