Protein–RNA interactions for Protein: F7CXE4

Gm7535, Predicted gene 7535, mousemouse

Predictions only

Length 302 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm7535F7CXE4 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gm7535F7CXE4 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gm7535F7CXE4 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gm7535F7CXE4 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gm7535F7CXE4 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gm7535F7CXE4 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gm7535F7CXE4 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gm7535F7CXE4 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gm7535F7CXE4 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gm7535F7CXE4 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gm7535F7CXE4 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gm7535F7CXE4 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Gm7535F7CXE4 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Gm7535F7CXE4 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gm7535F7CXE4 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gm7535F7CXE4 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gm7535F7CXE4 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gm7535F7CXE4 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gm7535F7CXE4 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gm7535F7CXE4 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gm7535F7CXE4 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gm7535F7CXE4 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gm7535F7CXE4 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gm7535F7CXE4 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Gm7535F7CXE4 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gm7535F7CXE4 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gm7535F7CXE4 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gm7535F7CXE4 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gm7535F7CXE4 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gm7535F7CXE4 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gm7535F7CXE4 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Gm7535F7CXE4 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gm7535F7CXE4 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gm7535F7CXE4 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gm7535F7CXE4 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gm7535F7CXE4 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gm7535F7CXE4 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gm7535F7CXE4 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gm7535F7CXE4 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gm7535F7CXE4 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gm7535F7CXE4 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gm7535F7CXE4 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gm7535F7CXE4 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gm7535F7CXE4 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gm7535F7CXE4 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gm7535F7CXE4 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gm7535F7CXE4 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gm7535F7CXE4 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gm7535F7CXE4 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Gm7535F7CXE4 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gm7535F7CXE4 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Gm7535F7CXE4 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gm7535F7CXE4 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gm7535F7CXE4 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gm7535F7CXE4 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gm7535F7CXE4 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gm7535F7CXE4 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gm7535F7CXE4 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gm7535F7CXE4 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gm7535F7CXE4 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Gm7535F7CXE4 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Gm7535F7CXE4 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Gm7535F7CXE4 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Gm7535F7CXE4 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gm7535F7CXE4 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gm7535F7CXE4 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gm7535F7CXE4 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gm7535F7CXE4 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gm7535F7CXE4 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gm7535F7CXE4 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gm7535F7CXE4 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gm7535F7CXE4 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gm7535F7CXE4 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gm7535F7CXE4 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gm7535F7CXE4 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gm7535F7CXE4 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gm7535F7CXE4 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gm7535F7CXE4 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gm7535F7CXE4 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gm7535F7CXE4 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Gm7535F7CXE4 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gm7535F7CXE4 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gm7535F7CXE4 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gm7535F7CXE4 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gm7535F7CXE4 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gm7535F7CXE4 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gm7535F7CXE4 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gm7535F7CXE4 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gm7535F7CXE4 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gm7535F7CXE4 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gm7535F7CXE4 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gm7535F7CXE4 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gm7535F7CXE4 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gm7535F7CXE4 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gm7535F7CXE4 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gm7535F7CXE4 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Gm7535F7CXE4 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Gm7535F7CXE4 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Gm7535F7CXE4 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Gm7535F7CXE4 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 152.2 ms