Protein–RNA interactions for Protein: F7BE40

Arl9, ADP-ribosylation factor-like 9 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 171 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arl9F7BE40 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Arl9F7BE40 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Arl9F7BE40 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Arl9F7BE40 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Arl9F7BE40 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Arl9F7BE40 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Arl9F7BE40 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Arl9F7BE40 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Arl9F7BE40 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Arl9F7BE40 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Arl9F7BE40 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Arl9F7BE40 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Arl9F7BE40 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Arl9F7BE40 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Arl9F7BE40 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Arl9F7BE40 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Arl9F7BE40 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Arl9F7BE40 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Arl9F7BE40 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Arl9F7BE40 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Arl9F7BE40 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Arl9F7BE40 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Arl9F7BE40 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Arl9F7BE40 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Arl9F7BE40 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Arl9F7BE40 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Arl9F7BE40 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Arl9F7BE40 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Arl9F7BE40 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Arl9F7BE40 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Arl9F7BE40 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Arl9F7BE40 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Arl9F7BE40 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Arl9F7BE40 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Arl9F7BE40 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Arl9F7BE40 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Arl9F7BE40 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Arl9F7BE40 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Arl9F7BE40 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Arl9F7BE40 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Arl9F7BE40 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Arl9F7BE40 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Arl9F7BE40 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Arl9F7BE40 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Arl9F7BE40 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Arl9F7BE40 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Arl9F7BE40 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Arl9F7BE40 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Arl9F7BE40 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Arl9F7BE40 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Arl9F7BE40 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Arl9F7BE40 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Arl9F7BE40 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Arl9F7BE40 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Arl9F7BE40 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Arl9F7BE40 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Arl9F7BE40 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Arl9F7BE40 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Arl9F7BE40 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Arl9F7BE40 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Arl9F7BE40 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Arl9F7BE40 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Arl9F7BE40 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Arl9F7BE40 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Arl9F7BE40 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Arl9F7BE40 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Arl9F7BE40 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Arl9F7BE40 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Arl9F7BE40 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Arl9F7BE40 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Arl9F7BE40 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Arl9F7BE40 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Arl9F7BE40 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Arl9F7BE40 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Arl9F7BE40 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Arl9F7BE40 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Arl9F7BE40 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Arl9F7BE40 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Arl9F7BE40 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Arl9F7BE40 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Arl9F7BE40 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Arl9F7BE40 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Arl9F7BE40 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Arl9F7BE40 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Arl9F7BE40 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Arl9F7BE40 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Arl9F7BE40 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Arl9F7BE40 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Arl9F7BE40 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Arl9F7BE40 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Arl9F7BE40 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Arl9F7BE40 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Arl9F7BE40 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Arl9F7BE40 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Arl9F7BE40 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Arl9F7BE40 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Arl9F7BE40 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Arl9F7BE40 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Arl9F7BE40 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Arl9F7BE40 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.8 ms