Protein–RNA interactions for Protein: F6YTZ4

Gm6576, Predicted gene 6576, mousemouse

Predictions only

Length 274 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6576F6YTZ4 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gm6576F6YTZ4 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gm6576F6YTZ4 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gm6576F6YTZ4 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gm6576F6YTZ4 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gm6576F6YTZ4 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gm6576F6YTZ4 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gm6576F6YTZ4 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gm6576F6YTZ4 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm6576F6YTZ4 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm6576F6YTZ4 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm6576F6YTZ4 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm6576F6YTZ4 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm6576F6YTZ4 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm6576F6YTZ4 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm6576F6YTZ4 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Gm6576F6YTZ4 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gm6576F6YTZ4 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gm6576F6YTZ4 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Gm6576F6YTZ4 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gm6576F6YTZ4 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm6576F6YTZ4 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm6576F6YTZ4 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm6576F6YTZ4 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm6576F6YTZ4 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm6576F6YTZ4 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm6576F6YTZ4 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm6576F6YTZ4 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm6576F6YTZ4 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm6576F6YTZ4 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm6576F6YTZ4 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm6576F6YTZ4 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm6576F6YTZ4 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm6576F6YTZ4 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm6576F6YTZ4 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Gm6576F6YTZ4 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gm6576F6YTZ4 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm6576F6YTZ4 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm6576F6YTZ4 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm6576F6YTZ4 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm6576F6YTZ4 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm6576F6YTZ4 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm6576F6YTZ4 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm6576F6YTZ4 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gm6576F6YTZ4 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gm6576F6YTZ4 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gm6576F6YTZ4 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gm6576F6YTZ4 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm6576F6YTZ4 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm6576F6YTZ4 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm6576F6YTZ4 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm6576F6YTZ4 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm6576F6YTZ4 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm6576F6YTZ4 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm6576F6YTZ4 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm6576F6YTZ4 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm6576F6YTZ4 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm6576F6YTZ4 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm6576F6YTZ4 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm6576F6YTZ4 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm6576F6YTZ4 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm6576F6YTZ4 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm6576F6YTZ4 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm6576F6YTZ4 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm6576F6YTZ4 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm6576F6YTZ4 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gm6576F6YTZ4 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gm6576F6YTZ4 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gm6576F6YTZ4 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gm6576F6YTZ4 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gm6576F6YTZ4 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm6576F6YTZ4 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm6576F6YTZ4 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm6576F6YTZ4 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm6576F6YTZ4 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm6576F6YTZ4 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm6576F6YTZ4 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm6576F6YTZ4 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm6576F6YTZ4 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm6576F6YTZ4 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm6576F6YTZ4 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm6576F6YTZ4 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm6576F6YTZ4 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm6576F6YTZ4 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm6576F6YTZ4 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm6576F6YTZ4 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm6576F6YTZ4 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Gm6576F6YTZ4 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Gm6576F6YTZ4 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gm6576F6YTZ4 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gm6576F6YTZ4 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gm6576F6YTZ4 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm6576F6YTZ4 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm6576F6YTZ4 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm6576F6YTZ4 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm6576F6YTZ4 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm6576F6YTZ4 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm6576F6YTZ4 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm6576F6YTZ4 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm6576F6YTZ4 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.4 ms