Protein–RNA interactions for Protein: F6XS56

Gm8444, Predicted gene 8444, mousemouse

Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8444F6XS56 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Gm8444F6XS56 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Gm8444F6XS56 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Gm8444F6XS56 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Gm8444F6XS56 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gm8444F6XS56 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gm8444F6XS56 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gm8444F6XS56 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gm8444F6XS56 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Gm8444F6XS56 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Gm8444F6XS56 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Gm8444F6XS56 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Gm8444F6XS56 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Gm8444F6XS56 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Gm8444F6XS56 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Gm8444F6XS56 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Gm8444F6XS56 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Gm8444F6XS56 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Gm8444F6XS56 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Gm8444F6XS56 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gm8444F6XS56 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gm8444F6XS56 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Gm8444F6XS56 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Gm8444F6XS56 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Gm8444F6XS56 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Gm8444F6XS56 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Gm8444F6XS56 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Gm8444F6XS56 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Gm8444F6XS56 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gm8444F6XS56 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gm8444F6XS56 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gm8444F6XS56 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gm8444F6XS56 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gm8444F6XS56 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gm8444F6XS56 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gm8444F6XS56 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gm8444F6XS56 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Gm8444F6XS56 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Gm8444F6XS56 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gm8444F6XS56 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gm8444F6XS56 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gm8444F6XS56 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gm8444F6XS56 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gm8444F6XS56 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gm8444F6XS56 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gm8444F6XS56 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gm8444F6XS56 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gm8444F6XS56 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gm8444F6XS56 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gm8444F6XS56 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gm8444F6XS56 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gm8444F6XS56 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gm8444F6XS56 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gm8444F6XS56 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gm8444F6XS56 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Gm8444F6XS56 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gm8444F6XS56 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gm8444F6XS56 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gm8444F6XS56 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gm8444F6XS56 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gm8444F6XS56 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gm8444F6XS56 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gm8444F6XS56 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gm8444F6XS56 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gm8444F6XS56 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gm8444F6XS56 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gm8444F6XS56 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gm8444F6XS56 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gm8444F6XS56 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gm8444F6XS56 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gm8444F6XS56 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gm8444F6XS56 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gm8444F6XS56 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gm8444F6XS56 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Gm8444F6XS56 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gm8444F6XS56 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Gm8444F6XS56 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Gm8444F6XS56 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gm8444F6XS56 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gm8444F6XS56 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gm8444F6XS56 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Gm8444F6XS56 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Gm8444F6XS56 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Gm8444F6XS56 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Gm8444F6XS56 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Gm8444F6XS56 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gm8444F6XS56 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gm8444F6XS56 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gm8444F6XS56 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gm8444F6XS56 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gm8444F6XS56 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gm8444F6XS56 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gm8444F6XS56 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gm8444F6XS56 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gm8444F6XS56 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gm8444F6XS56 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gm8444F6XS56 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gm8444F6XS56 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gm8444F6XS56 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gm8444F6XS56 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms