Protein–RNA interactions for Protein: F6XK35

Gm21876, Predicted gene, 21876, mousemouse

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21876F6XK35 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm21876F6XK35 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm21876F6XK35 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm21876F6XK35 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm21876F6XK35 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm21876F6XK35 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm21876F6XK35 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm21876F6XK35 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm21876F6XK35 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Gm21876F6XK35 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm21876F6XK35 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm21876F6XK35 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm21876F6XK35 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm21876F6XK35 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm21876F6XK35 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm21876F6XK35 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm21876F6XK35 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm21876F6XK35 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm21876F6XK35 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm21876F6XK35 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm21876F6XK35 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm21876F6XK35 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm21876F6XK35 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm21876F6XK35 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm21876F6XK35 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm21876F6XK35 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm21876F6XK35 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gm21876F6XK35 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gm21876F6XK35 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Gm21876F6XK35 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm21876F6XK35 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm21876F6XK35 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm21876F6XK35 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm21876F6XK35 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm21876F6XK35 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm21876F6XK35 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm21876F6XK35 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm21876F6XK35 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm21876F6XK35 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm21876F6XK35 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm21876F6XK35 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm21876F6XK35 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm21876F6XK35 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm21876F6XK35 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm21876F6XK35 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm21876F6XK35 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gm21876F6XK35 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gm21876F6XK35 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gm21876F6XK35 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gm21876F6XK35 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gm21876F6XK35 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm21876F6XK35 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm21876F6XK35 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm21876F6XK35 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm21876F6XK35 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm21876F6XK35 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm21876F6XK35 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm21876F6XK35 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm21876F6XK35 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm21876F6XK35 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm21876F6XK35 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm21876F6XK35 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm21876F6XK35 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm21876F6XK35 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gm21876F6XK35 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm21876F6XK35 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm21876F6XK35 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm21876F6XK35 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm21876F6XK35 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm21876F6XK35 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm21876F6XK35 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm21876F6XK35 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm21876F6XK35 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm21876F6XK35 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm21876F6XK35 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm21876F6XK35 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm21876F6XK35 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gm21876F6XK35 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gm21876F6XK35 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gm21876F6XK35 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gm21876F6XK35 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm21876F6XK35 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm21876F6XK35 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm21876F6XK35 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm21876F6XK35 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm21876F6XK35 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm21876F6XK35 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm21876F6XK35 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm21876F6XK35 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm21876F6XK35 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gm21876F6XK35 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Gm21876F6XK35 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Gm21876F6XK35 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gm21876F6XK35 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gm21876F6XK35 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gm21876F6XK35 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm21876F6XK35 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm21876F6XK35 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gm21876F6XK35 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gm21876F6XK35 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms