Protein–RNA interactions for Protein: F6X8D5

Gm42421, Predicted gene, 42421 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm42421F6X8D5 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm42421F6X8D5 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm42421F6X8D5 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm42421F6X8D5 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm42421F6X8D5 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm42421F6X8D5 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm42421F6X8D5 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm42421F6X8D5 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm42421F6X8D5 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm42421F6X8D5 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm42421F6X8D5 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm42421F6X8D5 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm42421F6X8D5 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm42421F6X8D5 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm42421F6X8D5 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm42421F6X8D5 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm42421F6X8D5 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm42421F6X8D5 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm42421F6X8D5 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm42421F6X8D5 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm42421F6X8D5 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm42421F6X8D5 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm42421F6X8D5 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm42421F6X8D5 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm42421F6X8D5 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm42421F6X8D5 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm42421F6X8D5 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm42421F6X8D5 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm42421F6X8D5 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Gm42421F6X8D5 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gm42421F6X8D5 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm42421F6X8D5 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm42421F6X8D5 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm42421F6X8D5 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm42421F6X8D5 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm42421F6X8D5 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm42421F6X8D5 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm42421F6X8D5 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm42421F6X8D5 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm42421F6X8D5 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm42421F6X8D5 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm42421F6X8D5 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm42421F6X8D5 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm42421F6X8D5 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm42421F6X8D5 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm42421F6X8D5 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm42421F6X8D5 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm42421F6X8D5 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm42421F6X8D5 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm42421F6X8D5 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gm42421F6X8D5 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gm42421F6X8D5 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gm42421F6X8D5 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gm42421F6X8D5 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Gm42421F6X8D5 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm42421F6X8D5 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm42421F6X8D5 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm42421F6X8D5 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm42421F6X8D5 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gm42421F6X8D5 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gm42421F6X8D5 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gm42421F6X8D5 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gm42421F6X8D5 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Gm42421F6X8D5 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gm42421F6X8D5 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gm42421F6X8D5 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gm42421F6X8D5 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm42421F6X8D5 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm42421F6X8D5 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm42421F6X8D5 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm42421F6X8D5 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm42421F6X8D5 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm42421F6X8D5 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm42421F6X8D5 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gm42421F6X8D5 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm42421F6X8D5 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm42421F6X8D5 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm42421F6X8D5 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm42421F6X8D5 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Gm42421F6X8D5 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Gm42421F6X8D5 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Gm42421F6X8D5 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Gm42421F6X8D5 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gm42421F6X8D5 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gm42421F6X8D5 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gm42421F6X8D5 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gm42421F6X8D5 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gm42421F6X8D5 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gm42421F6X8D5 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gm42421F6X8D5 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gm42421F6X8D5 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gm42421F6X8D5 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gm42421F6X8D5 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Gm42421F6X8D5 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gm42421F6X8D5 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gm42421F6X8D5 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Gm42421F6X8D5 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gm42421F6X8D5 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gm42421F6X8D5 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gm42421F6X8D5 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 120.1 ms