Protein–RNA interactions for Protein: F6VRN1

Smgc, Submandibular gland protein C (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SmgcF6VRN1 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SmgcF6VRN1 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SmgcF6VRN1 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
SmgcF6VRN1 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SmgcF6VRN1 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SmgcF6VRN1 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SmgcF6VRN1 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SmgcF6VRN1 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SmgcF6VRN1 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SmgcF6VRN1 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SmgcF6VRN1 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SmgcF6VRN1 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SmgcF6VRN1 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SmgcF6VRN1 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SmgcF6VRN1 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SmgcF6VRN1 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SmgcF6VRN1 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SmgcF6VRN1 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SmgcF6VRN1 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SmgcF6VRN1 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SmgcF6VRN1 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SmgcF6VRN1 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SmgcF6VRN1 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SmgcF6VRN1 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SmgcF6VRN1 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SmgcF6VRN1 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SmgcF6VRN1 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SmgcF6VRN1 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SmgcF6VRN1 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SmgcF6VRN1 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SmgcF6VRN1 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SmgcF6VRN1 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SmgcF6VRN1 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SmgcF6VRN1 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SmgcF6VRN1 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SmgcF6VRN1 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SmgcF6VRN1 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SmgcF6VRN1 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SmgcF6VRN1 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SmgcF6VRN1 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SmgcF6VRN1 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SmgcF6VRN1 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SmgcF6VRN1 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SmgcF6VRN1 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SmgcF6VRN1 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SmgcF6VRN1 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SmgcF6VRN1 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SmgcF6VRN1 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SmgcF6VRN1 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SmgcF6VRN1 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SmgcF6VRN1 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SmgcF6VRN1 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SmgcF6VRN1 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SmgcF6VRN1 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SmgcF6VRN1 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SmgcF6VRN1 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SmgcF6VRN1 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SmgcF6VRN1 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SmgcF6VRN1 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SmgcF6VRN1 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SmgcF6VRN1 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SmgcF6VRN1 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SmgcF6VRN1 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
SmgcF6VRN1 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SmgcF6VRN1 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
SmgcF6VRN1 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SmgcF6VRN1 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SmgcF6VRN1 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SmgcF6VRN1 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SmgcF6VRN1 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SmgcF6VRN1 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SmgcF6VRN1 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SmgcF6VRN1 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
SmgcF6VRN1 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SmgcF6VRN1 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SmgcF6VRN1 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SmgcF6VRN1 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SmgcF6VRN1 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
SmgcF6VRN1 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SmgcF6VRN1 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SmgcF6VRN1 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SmgcF6VRN1 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SmgcF6VRN1 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SmgcF6VRN1 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SmgcF6VRN1 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SmgcF6VRN1 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SmgcF6VRN1 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SmgcF6VRN1 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SmgcF6VRN1 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SmgcF6VRN1 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SmgcF6VRN1 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SmgcF6VRN1 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SmgcF6VRN1 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SmgcF6VRN1 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
SmgcF6VRN1 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
SmgcF6VRN1 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SmgcF6VRN1 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SmgcF6VRN1 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SmgcF6VRN1 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SmgcF6VRN1 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms