Protein–RNA interactions for Protein: F6UK53

4933403O08Rik, MCG62900, mousemouse

Predictions only

Length 379 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933403O08RikF6UK53 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
4933403O08RikF6UK53 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
4933403O08RikF6UK53 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
4933403O08RikF6UK53 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
4933403O08RikF6UK53 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
4933403O08RikF6UK53 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
4933403O08RikF6UK53 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
4933403O08RikF6UK53 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
4933403O08RikF6UK53 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
4933403O08RikF6UK53 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
4933403O08RikF6UK53 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
4933403O08RikF6UK53 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
4933403O08RikF6UK53 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
4933403O08RikF6UK53 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
4933403O08RikF6UK53 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
4933403O08RikF6UK53 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
4933403O08RikF6UK53 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
4933403O08RikF6UK53 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
4933403O08RikF6UK53 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
4933403O08RikF6UK53 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
4933403O08RikF6UK53 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
4933403O08RikF6UK53 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
4933403O08RikF6UK53 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
4933403O08RikF6UK53 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
4933403O08RikF6UK53 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
4933403O08RikF6UK53 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
4933403O08RikF6UK53 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
4933403O08RikF6UK53 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
4933403O08RikF6UK53 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
4933403O08RikF6UK53 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
4933403O08RikF6UK53 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
4933403O08RikF6UK53 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
4933403O08RikF6UK53 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
4933403O08RikF6UK53 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
4933403O08RikF6UK53 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
4933403O08RikF6UK53 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
4933403O08RikF6UK53 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
4933403O08RikF6UK53 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
4933403O08RikF6UK53 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
4933403O08RikF6UK53 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
4933403O08RikF6UK53 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
4933403O08RikF6UK53 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
4933403O08RikF6UK53 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
4933403O08RikF6UK53 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
4933403O08RikF6UK53 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
4933403O08RikF6UK53 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
4933403O08RikF6UK53 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
4933403O08RikF6UK53 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
4933403O08RikF6UK53 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
4933403O08RikF6UK53 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
4933403O08RikF6UK53 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
4933403O08RikF6UK53 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
4933403O08RikF6UK53 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
4933403O08RikF6UK53 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
4933403O08RikF6UK53 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
4933403O08RikF6UK53 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
4933403O08RikF6UK53 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
4933403O08RikF6UK53 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
4933403O08RikF6UK53 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
4933403O08RikF6UK53 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
4933403O08RikF6UK53 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
4933403O08RikF6UK53 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
4933403O08RikF6UK53 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
4933403O08RikF6UK53 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
4933403O08RikF6UK53 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
4933403O08RikF6UK53 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
4933403O08RikF6UK53 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
4933403O08RikF6UK53 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
4933403O08RikF6UK53 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
4933403O08RikF6UK53 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
4933403O08RikF6UK53 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
4933403O08RikF6UK53 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
4933403O08RikF6UK53 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
4933403O08RikF6UK53 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
4933403O08RikF6UK53 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
4933403O08RikF6UK53 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
4933403O08RikF6UK53 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
4933403O08RikF6UK53 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
4933403O08RikF6UK53 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
4933403O08RikF6UK53 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
4933403O08RikF6UK53 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
4933403O08RikF6UK53 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
4933403O08RikF6UK53 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
4933403O08RikF6UK53 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
4933403O08RikF6UK53 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
4933403O08RikF6UK53 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
4933403O08RikF6UK53 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
4933403O08RikF6UK53 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
4933403O08RikF6UK53 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
4933403O08RikF6UK53 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
4933403O08RikF6UK53 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
4933403O08RikF6UK53 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
4933403O08RikF6UK53 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
4933403O08RikF6UK53 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
4933403O08RikF6UK53 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
4933403O08RikF6UK53 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
4933403O08RikF6UK53 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
4933403O08RikF6UK53 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
4933403O08RikF6UK53 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
4933403O08RikF6UK53 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms