Protein–RNA interactions for Protein: F6TQD1

Rnf212, Probable E3 SUMO-protein ligase RNF212, mousemouse

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf212F6TQD1 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rnf212F6TQD1 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rnf212F6TQD1 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rnf212F6TQD1 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rnf212F6TQD1 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rnf212F6TQD1 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rnf212F6TQD1 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rnf212F6TQD1 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rnf212F6TQD1 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rnf212F6TQD1 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rnf212F6TQD1 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rnf212F6TQD1 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rnf212F6TQD1 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rnf212F6TQD1 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rnf212F6TQD1 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rnf212F6TQD1 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Rnf212F6TQD1 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Rnf212F6TQD1 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rnf212F6TQD1 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rnf212F6TQD1 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rnf212F6TQD1 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rnf212F6TQD1 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rnf212F6TQD1 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Rnf212F6TQD1 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rnf212F6TQD1 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rnf212F6TQD1 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rnf212F6TQD1 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rnf212F6TQD1 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rnf212F6TQD1 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rnf212F6TQD1 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rnf212F6TQD1 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rnf212F6TQD1 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Rnf212F6TQD1 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rnf212F6TQD1 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rnf212F6TQD1 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rnf212F6TQD1 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rnf212F6TQD1 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rnf212F6TQD1 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rnf212F6TQD1 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rnf212F6TQD1 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rnf212F6TQD1 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rnf212F6TQD1 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rnf212F6TQD1 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rnf212F6TQD1 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Rnf212F6TQD1 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rnf212F6TQD1 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rnf212F6TQD1 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rnf212F6TQD1 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rnf212F6TQD1 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rnf212F6TQD1 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rnf212F6TQD1 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rnf212F6TQD1 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rnf212F6TQD1 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rnf212F6TQD1 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rnf212F6TQD1 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Rnf212F6TQD1 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rnf212F6TQD1 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rnf212F6TQD1 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rnf212F6TQD1 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rnf212F6TQD1 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rnf212F6TQD1 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rnf212F6TQD1 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rnf212F6TQD1 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rnf212F6TQD1 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rnf212F6TQD1 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rnf212F6TQD1 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rnf212F6TQD1 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rnf212F6TQD1 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Rnf212F6TQD1 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rnf212F6TQD1 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC18.39■□□□□ 0.54
Rnf212F6TQD1 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rnf212F6TQD1 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rnf212F6TQD1 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rnf212F6TQD1 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rnf212F6TQD1 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rnf212F6TQD1 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rnf212F6TQD1 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rnf212F6TQD1 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rnf212F6TQD1 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rnf212F6TQD1 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rnf212F6TQD1 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rnf212F6TQD1 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rnf212F6TQD1 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rnf212F6TQD1 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rnf212F6TQD1 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rnf212F6TQD1 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rnf212F6TQD1 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rnf212F6TQD1 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rnf212F6TQD1 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rnf212F6TQD1 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rnf212F6TQD1 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Rnf212F6TQD1 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Rnf212F6TQD1 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Rnf212F6TQD1 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rnf212F6TQD1 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rnf212F6TQD1 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rnf212F6TQD1 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rnf212F6TQD1 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rnf212F6TQD1 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rnf212F6TQD1 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms