Protein–RNA interactions for Protein: E9QAU8

Rnf165, E3 ubiquitin-protein ligase RNF165, mousemouse

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf165E9QAU8 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rnf165E9QAU8 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rnf165E9QAU8 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rnf165E9QAU8 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rnf165E9QAU8 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rnf165E9QAU8 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rnf165E9QAU8 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rnf165E9QAU8 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rnf165E9QAU8 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rnf165E9QAU8 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rnf165E9QAU8 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rnf165E9QAU8 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rnf165E9QAU8 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rnf165E9QAU8 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rnf165E9QAU8 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rnf165E9QAU8 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rnf165E9QAU8 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rnf165E9QAU8 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rnf165E9QAU8 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rnf165E9QAU8 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rnf165E9QAU8 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rnf165E9QAU8 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rnf165E9QAU8 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rnf165E9QAU8 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rnf165E9QAU8 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rnf165E9QAU8 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rnf165E9QAU8 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rnf165E9QAU8 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Rnf165E9QAU8 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rnf165E9QAU8 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rnf165E9QAU8 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rnf165E9QAU8 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rnf165E9QAU8 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rnf165E9QAU8 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rnf165E9QAU8 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rnf165E9QAU8 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rnf165E9QAU8 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rnf165E9QAU8 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rnf165E9QAU8 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rnf165E9QAU8 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rnf165E9QAU8 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rnf165E9QAU8 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rnf165E9QAU8 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rnf165E9QAU8 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rnf165E9QAU8 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Rnf165E9QAU8 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rnf165E9QAU8 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rnf165E9QAU8 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rnf165E9QAU8 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rnf165E9QAU8 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rnf165E9QAU8 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rnf165E9QAU8 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rnf165E9QAU8 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rnf165E9QAU8 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rnf165E9QAU8 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rnf165E9QAU8 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rnf165E9QAU8 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rnf165E9QAU8 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Rnf165E9QAU8 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rnf165E9QAU8 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rnf165E9QAU8 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rnf165E9QAU8 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rnf165E9QAU8 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rnf165E9QAU8 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rnf165E9QAU8 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rnf165E9QAU8 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rnf165E9QAU8 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Rnf165E9QAU8 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rnf165E9QAU8 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rnf165E9QAU8 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rnf165E9QAU8 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Rnf165E9QAU8 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rnf165E9QAU8 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rnf165E9QAU8 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rnf165E9QAU8 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rnf165E9QAU8 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Rnf165E9QAU8 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rnf165E9QAU8 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rnf165E9QAU8 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rnf165E9QAU8 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rnf165E9QAU8 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rnf165E9QAU8 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rnf165E9QAU8 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
Rnf165E9QAU8 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rnf165E9QAU8 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rnf165E9QAU8 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rnf165E9QAU8 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rnf165E9QAU8 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rnf165E9QAU8 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rnf165E9QAU8 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rnf165E9QAU8 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rnf165E9QAU8 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rnf165E9QAU8 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Rnf165E9QAU8 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Rnf165E9QAU8 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rnf165E9QAU8 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rnf165E9QAU8 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rnf165E9QAU8 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rnf165E9QAU8 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rnf165E9QAU8 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 161.1 ms