Protein–RNA interactions for Protein: E9QAN8

Pik3c2b, Phosphatidylinositol-4-phosphate 3-kinase catalytic subunit type 2 beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,632 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pik3c2bE9QAN8 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC34.13■■■■□ 3.05
Pik3c2bE9QAN8 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
Pik3c2bE9QAN8 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
Pik3c2bE9QAN8 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
Pik3c2bE9QAN8 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.12■■■■□ 3.05
Pik3c2bE9QAN8 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
Pik3c2bE9QAN8 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.1■■■■□ 3.05
Pik3c2bE9QAN8 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC34.1■■■■□ 3.05
Pik3c2bE9QAN8 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
Pik3c2bE9QAN8 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC34.09■■■■□ 3.05
Pik3c2bE9QAN8 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
Pik3c2bE9QAN8 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC34.07■■■■□ 3.04
Pik3c2bE9QAN8 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
Pik3c2bE9QAN8 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
Pik3c2bE9QAN8 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
Pik3c2bE9QAN8 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC34.03■■■■□ 3.04
Pik3c2bE9QAN8 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
Pik3c2bE9QAN8 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
Pik3c2bE9QAN8 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC34.02■■■■□ 3.04
Pik3c2bE9QAN8 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC34.02■■■■□ 3.04
Pik3c2bE9QAN8 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC34.02■■■■□ 3.04
Pik3c2bE9QAN8 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC34.01■■■■□ 3.04
Pik3c2bE9QAN8 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
Pik3c2bE9QAN8 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC33.98■■■■□ 3.03
Pik3c2bE9QAN8 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
Pik3c2bE9QAN8 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC33.96■■■■□ 3.03
Pik3c2bE9QAN8 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC33.96■■■■□ 3.03
Pik3c2bE9QAN8 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
Pik3c2bE9QAN8 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.02
Pik3c2bE9QAN8 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
Pik3c2bE9QAN8 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC33.92■■■■□ 3.02
Pik3c2bE9QAN8 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
Pik3c2bE9QAN8 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC33.91■■■■□ 3.02
Pik3c2bE9QAN8 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC33.9■■■■□ 3.02
Pik3c2bE9QAN8 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
Pik3c2bE9QAN8 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
Pik3c2bE9QAN8 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC33.86■■■■□ 3.01
Pik3c2bE9QAN8 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
Pik3c2bE9QAN8 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC33.85■■■■□ 3.01
Pik3c2bE9QAN8 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC33.82■■■■□ 3
Pik3c2bE9QAN8 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
Pik3c2bE9QAN8 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
Pik3c2bE9QAN8 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
Pik3c2bE9QAN8 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
Pik3c2bE9QAN8 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
Pik3c2bE9QAN8 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.77■■■■□ 3
Pik3c2bE9QAN8 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
Pik3c2bE9QAN8 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
Pik3c2bE9QAN8 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC33.75■■■□□ 2.99
Pik3c2bE9QAN8 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
Pik3c2bE9QAN8 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
Pik3c2bE9QAN8 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
Pik3c2bE9QAN8 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
Pik3c2bE9QAN8 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
Pik3c2bE9QAN8 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC33.72■■■□□ 2.99
Pik3c2bE9QAN8 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
Pik3c2bE9QAN8 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
Pik3c2bE9QAN8 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
Pik3c2bE9QAN8 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
Pik3c2bE9QAN8 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
Pik3c2bE9QAN8 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
Pik3c2bE9QAN8 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
Pik3c2bE9QAN8 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
Pik3c2bE9QAN8 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
Pik3c2bE9QAN8 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC33.64■■■□□ 2.98
Pik3c2bE9QAN8 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.64■■■□□ 2.98
Pik3c2bE9QAN8 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
Pik3c2bE9QAN8 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.64■■■□□ 2.98
Pik3c2bE9QAN8 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC33.63■■■□□ 2.97
Pik3c2bE9QAN8 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC33.62■■■□□ 2.97
Pik3c2bE9QAN8 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.61■■■□□ 2.97
Pik3c2bE9QAN8 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC33.61■■■□□ 2.97
Pik3c2bE9QAN8 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC33.61■■■□□ 2.97
Pik3c2bE9QAN8 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.61■■■□□ 2.97
Pik3c2bE9QAN8 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
Pik3c2bE9QAN8 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.61■■■□□ 2.97
Pik3c2bE9QAN8 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.6■■■□□ 2.97
Pik3c2bE9QAN8 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
Pik3c2bE9QAN8 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC33.6■■■□□ 2.97
Pik3c2bE9QAN8 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
Pik3c2bE9QAN8 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
Pik3c2bE9QAN8 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
Pik3c2bE9QAN8 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC33.59■■■□□ 2.97
Pik3c2bE9QAN8 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC33.58■■■□□ 2.97
Pik3c2bE9QAN8 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC33.57■■■□□ 2.97
Pik3c2bE9QAN8 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
Pik3c2bE9QAN8 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC33.57■■■□□ 2.96
Pik3c2bE9QAN8 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC33.57■■■□□ 2.96
Pik3c2bE9QAN8 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.57■■■□□ 2.96
Pik3c2bE9QAN8 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC33.57■■■□□ 2.96
Pik3c2bE9QAN8 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
Pik3c2bE9QAN8 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
Pik3c2bE9QAN8 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
Pik3c2bE9QAN8 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.55■■■□□ 2.96
Pik3c2bE9QAN8 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC33.53■■■□□ 2.96
Pik3c2bE9QAN8 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
Pik3c2bE9QAN8 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
Pik3c2bE9QAN8 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
Pik3c2bE9QAN8 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
Pik3c2bE9QAN8 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms