Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9Y3

Ccdc7b, Coiled-coil domain-containing 7B, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc7bE9Q9Y3 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc7bE9Q9Y3 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc7bE9Q9Y3 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc7bE9Q9Y3 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc7bE9Q9Y3 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc7bE9Q9Y3 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc7bE9Q9Y3 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc7bE9Q9Y3 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc7bE9Q9Y3 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc7bE9Q9Y3 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc7bE9Q9Y3 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc7bE9Q9Y3 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc7bE9Q9Y3 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc7bE9Q9Y3 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc7bE9Q9Y3 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc7bE9Q9Y3 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc7bE9Q9Y3 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc7bE9Q9Y3 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc7bE9Q9Y3 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc7bE9Q9Y3 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc7bE9Q9Y3 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc7bE9Q9Y3 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc7bE9Q9Y3 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc7bE9Q9Y3 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc7bE9Q9Y3 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc7bE9Q9Y3 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc7bE9Q9Y3 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc7bE9Q9Y3 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc7bE9Q9Y3 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc7bE9Q9Y3 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc7bE9Q9Y3 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc7bE9Q9Y3 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc7bE9Q9Y3 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc7bE9Q9Y3 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc7bE9Q9Y3 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc7bE9Q9Y3 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc7bE9Q9Y3 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc7bE9Q9Y3 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc7bE9Q9Y3 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc7bE9Q9Y3 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc7bE9Q9Y3 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc7bE9Q9Y3 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc7bE9Q9Y3 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc7bE9Q9Y3 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccdc7bE9Q9Y3 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccdc7bE9Q9Y3 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccdc7bE9Q9Y3 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ccdc7bE9Q9Y3 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc7bE9Q9Y3 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc7bE9Q9Y3 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc7bE9Q9Y3 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc7bE9Q9Y3 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc7bE9Q9Y3 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc7bE9Q9Y3 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc7bE9Q9Y3 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc7bE9Q9Y3 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc7bE9Q9Y3 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc7bE9Q9Y3 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc7bE9Q9Y3 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc7bE9Q9Y3 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc7bE9Q9Y3 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc7bE9Q9Y3 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc7bE9Q9Y3 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc7bE9Q9Y3 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc7bE9Q9Y3 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc7bE9Q9Y3 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc7bE9Q9Y3 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc7bE9Q9Y3 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc7bE9Q9Y3 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc7bE9Q9Y3 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc7bE9Q9Y3 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc7bE9Q9Y3 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc7bE9Q9Y3 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc7bE9Q9Y3 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc7bE9Q9Y3 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc7bE9Q9Y3 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc7bE9Q9Y3 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc7bE9Q9Y3 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc7bE9Q9Y3 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc7bE9Q9Y3 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc7bE9Q9Y3 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc7bE9Q9Y3 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc7bE9Q9Y3 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc7bE9Q9Y3 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc7bE9Q9Y3 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc7bE9Q9Y3 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc7bE9Q9Y3 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc7bE9Q9Y3 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc7bE9Q9Y3 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc7bE9Q9Y3 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc7bE9Q9Y3 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc7bE9Q9Y3 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc7bE9Q9Y3 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.4 ms