Protein–RNA interactions for Protein: E9Q6Y8

Usp31, Ubiquitin-specific peptidase 31, mousemouse

Predictions only

Length 1,344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp31E9Q6Y8 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Usp31E9Q6Y8 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Usp31E9Q6Y8 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Usp31E9Q6Y8 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Usp31E9Q6Y8 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Usp31E9Q6Y8 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Usp31E9Q6Y8 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Usp31E9Q6Y8 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Usp31E9Q6Y8 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Usp31E9Q6Y8 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Usp31E9Q6Y8 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Usp31E9Q6Y8 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Usp31E9Q6Y8 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Usp31E9Q6Y8 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Usp31E9Q6Y8 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Usp31E9Q6Y8 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Usp31E9Q6Y8 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Usp31E9Q6Y8 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Usp31E9Q6Y8 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Usp31E9Q6Y8 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Usp31E9Q6Y8 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Usp31E9Q6Y8 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Usp31E9Q6Y8 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Usp31E9Q6Y8 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Usp31E9Q6Y8 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Usp31E9Q6Y8 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Usp31E9Q6Y8 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Usp31E9Q6Y8 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Usp31E9Q6Y8 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Usp31E9Q6Y8 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Usp31E9Q6Y8 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
Usp31E9Q6Y8 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Usp31E9Q6Y8 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Usp31E9Q6Y8 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Usp31E9Q6Y8 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Usp31E9Q6Y8 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Usp31E9Q6Y8 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Usp31E9Q6Y8 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Usp31E9Q6Y8 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Usp31E9Q6Y8 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Usp31E9Q6Y8 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
Usp31E9Q6Y8 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Usp31E9Q6Y8 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Usp31E9Q6Y8 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Usp31E9Q6Y8 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Usp31E9Q6Y8 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Usp31E9Q6Y8 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Usp31E9Q6Y8 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Usp31E9Q6Y8 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Usp31E9Q6Y8 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Usp31E9Q6Y8 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Usp31E9Q6Y8 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Usp31E9Q6Y8 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Usp31E9Q6Y8 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Usp31E9Q6Y8 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Usp31E9Q6Y8 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Usp31E9Q6Y8 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Usp31E9Q6Y8 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Usp31E9Q6Y8 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Usp31E9Q6Y8 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Usp31E9Q6Y8 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Usp31E9Q6Y8 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Usp31E9Q6Y8 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Usp31E9Q6Y8 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Usp31E9Q6Y8 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Usp31E9Q6Y8 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Usp31E9Q6Y8 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Usp31E9Q6Y8 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Usp31E9Q6Y8 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Usp31E9Q6Y8 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Usp31E9Q6Y8 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Usp31E9Q6Y8 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Usp31E9Q6Y8 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Usp31E9Q6Y8 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Usp31E9Q6Y8 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Usp31E9Q6Y8 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Usp31E9Q6Y8 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Usp31E9Q6Y8 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Usp31E9Q6Y8 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Usp31E9Q6Y8 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Usp31E9Q6Y8 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Usp31E9Q6Y8 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
Usp31E9Q6Y8 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
Usp31E9Q6Y8 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Usp31E9Q6Y8 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Usp31E9Q6Y8 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
Usp31E9Q6Y8 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Usp31E9Q6Y8 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Usp31E9Q6Y8 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
Usp31E9Q6Y8 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Usp31E9Q6Y8 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Usp31E9Q6Y8 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Usp31E9Q6Y8 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Usp31E9Q6Y8 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Usp31E9Q6Y8 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
Usp31E9Q6Y8 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Usp31E9Q6Y8 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Usp31E9Q6Y8 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Usp31E9Q6Y8 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Usp31E9Q6Y8 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms