Protein–RNA interactions for Protein: E9Q512

Trip11, Thyroid hormone receptor interactor 11, mousemouse

Predictions only

Length 1,976 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip11E9Q512 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Trip11E9Q512 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Trip11E9Q512 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Trip11E9Q512 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Trip11E9Q512 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Trip11E9Q512 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Trip11E9Q512 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Trip11E9Q512 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Trip11E9Q512 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Trip11E9Q512 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Trip11E9Q512 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Trip11E9Q512 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Trip11E9Q512 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
Trip11E9Q512 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Trip11E9Q512 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Trip11E9Q512 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
Trip11E9Q512 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Trip11E9Q512 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Trip11E9Q512 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Trip11E9Q512 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Trip11E9Q512 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Trip11E9Q512 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Trip11E9Q512 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Trip11E9Q512 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Trip11E9Q512 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
Trip11E9Q512 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Trip11E9Q512 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Trip11E9Q512 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Trip11E9Q512 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Trip11E9Q512 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
Trip11E9Q512 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
Trip11E9Q512 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Trip11E9Q512 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Trip11E9Q512 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Trip11E9Q512 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Trip11E9Q512 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Trip11E9Q512 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Trip11E9Q512 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Trip11E9Q512 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Trip11E9Q512 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Trip11E9Q512 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Trip11E9Q512 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
Trip11E9Q512 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Trip11E9Q512 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Trip11E9Q512 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Trip11E9Q512 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
Trip11E9Q512 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Trip11E9Q512 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Trip11E9Q512 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Trip11E9Q512 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Trip11E9Q512 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
Trip11E9Q512 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Trip11E9Q512 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Trip11E9Q512 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Trip11E9Q512 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Trip11E9Q512 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Trip11E9Q512 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Trip11E9Q512 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Trip11E9Q512 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Trip11E9Q512 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Trip11E9Q512 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Trip11E9Q512 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Trip11E9Q512 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Trip11E9Q512 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Trip11E9Q512 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Trip11E9Q512 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Trip11E9Q512 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Trip11E9Q512 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Trip11E9Q512 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Trip11E9Q512 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Trip11E9Q512 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Trip11E9Q512 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Trip11E9Q512 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Trip11E9Q512 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Trip11E9Q512 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Trip11E9Q512 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
Trip11E9Q512 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Trip11E9Q512 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
Trip11E9Q512 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Trip11E9Q512 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Trip11E9Q512 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Trip11E9Q512 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Trip11E9Q512 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Trip11E9Q512 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Trip11E9Q512 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Trip11E9Q512 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
Trip11E9Q512 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Trip11E9Q512 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Trip11E9Q512 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Trip11E9Q512 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Trip11E9Q512 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Trip11E9Q512 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Trip11E9Q512 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Trip11E9Q512 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Trip11E9Q512 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Trip11E9Q512 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Trip11E9Q512 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
Trip11E9Q512 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Trip11E9Q512 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Trip11E9Q512 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms