Protein–RNA interactions for Protein: E9Q3L6

4930579F01Rik, RIKEN cDNA 4930579F01 gene, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930579F01RikE9Q3L6 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
4930579F01RikE9Q3L6 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
4930579F01RikE9Q3L6 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
4930579F01RikE9Q3L6 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
4930579F01RikE9Q3L6 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
4930579F01RikE9Q3L6 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
4930579F01RikE9Q3L6 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
4930579F01RikE9Q3L6 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
4930579F01RikE9Q3L6 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
4930579F01RikE9Q3L6 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
4930579F01RikE9Q3L6 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
4930579F01RikE9Q3L6 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
4930579F01RikE9Q3L6 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
4930579F01RikE9Q3L6 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
4930579F01RikE9Q3L6 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
4930579F01RikE9Q3L6 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
4930579F01RikE9Q3L6 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
4930579F01RikE9Q3L6 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
4930579F01RikE9Q3L6 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
4930579F01RikE9Q3L6 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
4930579F01RikE9Q3L6 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
4930579F01RikE9Q3L6 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
4930579F01RikE9Q3L6 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
4930579F01RikE9Q3L6 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
4930579F01RikE9Q3L6 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
4930579F01RikE9Q3L6 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
4930579F01RikE9Q3L6 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
4930579F01RikE9Q3L6 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
4930579F01RikE9Q3L6 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
4930579F01RikE9Q3L6 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
4930579F01RikE9Q3L6 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
4930579F01RikE9Q3L6 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
4930579F01RikE9Q3L6 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
4930579F01RikE9Q3L6 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
4930579F01RikE9Q3L6 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
4930579F01RikE9Q3L6 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
4930579F01RikE9Q3L6 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
4930579F01RikE9Q3L6 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
4930579F01RikE9Q3L6 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
4930579F01RikE9Q3L6 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
4930579F01RikE9Q3L6 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
4930579F01RikE9Q3L6 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
4930579F01RikE9Q3L6 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
4930579F01RikE9Q3L6 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
4930579F01RikE9Q3L6 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
4930579F01RikE9Q3L6 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
4930579F01RikE9Q3L6 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
4930579F01RikE9Q3L6 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
4930579F01RikE9Q3L6 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
4930579F01RikE9Q3L6 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
4930579F01RikE9Q3L6 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
4930579F01RikE9Q3L6 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
4930579F01RikE9Q3L6 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
4930579F01RikE9Q3L6 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
4930579F01RikE9Q3L6 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
4930579F01RikE9Q3L6 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
4930579F01RikE9Q3L6 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
4930579F01RikE9Q3L6 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
4930579F01RikE9Q3L6 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
4930579F01RikE9Q3L6 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
4930579F01RikE9Q3L6 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
4930579F01RikE9Q3L6 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
4930579F01RikE9Q3L6 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
4930579F01RikE9Q3L6 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
4930579F01RikE9Q3L6 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
4930579F01RikE9Q3L6 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
4930579F01RikE9Q3L6 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
4930579F01RikE9Q3L6 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
4930579F01RikE9Q3L6 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
4930579F01RikE9Q3L6 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
4930579F01RikE9Q3L6 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
4930579F01RikE9Q3L6 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
4930579F01RikE9Q3L6 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
4930579F01RikE9Q3L6 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
4930579F01RikE9Q3L6 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
4930579F01RikE9Q3L6 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
4930579F01RikE9Q3L6 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
4930579F01RikE9Q3L6 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
4930579F01RikE9Q3L6 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
4930579F01RikE9Q3L6 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
4930579F01RikE9Q3L6 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
4930579F01RikE9Q3L6 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
4930579F01RikE9Q3L6 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
4930579F01RikE9Q3L6 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
4930579F01RikE9Q3L6 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
4930579F01RikE9Q3L6 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
4930579F01RikE9Q3L6 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
4930579F01RikE9Q3L6 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
4930579F01RikE9Q3L6 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
4930579F01RikE9Q3L6 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
4930579F01RikE9Q3L6 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
4930579F01RikE9Q3L6 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
4930579F01RikE9Q3L6 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
4930579F01RikE9Q3L6 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
4930579F01RikE9Q3L6 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
4930579F01RikE9Q3L6 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
4930579F01RikE9Q3L6 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
4930579F01RikE9Q3L6 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
4930579F01RikE9Q3L6 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
4930579F01RikE9Q3L6 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms