Protein–RNA interactions for Protein: E9Q166

Atad2b, ATPase family, AAA domain-containing 2B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,460 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atad2bE9Q166 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC44.63■■■■■ 4.73
Atad2bE9Q166 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC44.63■■■■■ 4.73
Atad2bE9Q166 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC44.6■■■■■ 4.73
Atad2bE9Q166 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC44.59■■■■■ 4.73
Atad2bE9Q166 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.58■■■■■ 4.73
Atad2bE9Q166 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC44.58■■■■■ 4.73
Atad2bE9Q166 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC44.57■■■■■ 4.73
Atad2bE9Q166 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC44.57■■■■■ 4.73
Atad2bE9Q166 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC44.55■■■■■ 4.72
Atad2bE9Q166 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC44.55■■■■■ 4.72
Atad2bE9Q166 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC44.53■■■■■ 4.72
Atad2bE9Q166 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC44.52■■■■■ 4.72
Atad2bE9Q166 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.51■■■■■ 4.72
Atad2bE9Q166 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC44.49■■■■■ 4.71
Atad2bE9Q166 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.48■■■■■ 4.71
Atad2bE9Q166 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC44.47■■■■■ 4.71
Atad2bE9Q166 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.47■■■■■ 4.71
Atad2bE9Q166 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.46■■■■■ 4.71
Atad2bE9Q166 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC44.44■■■■■ 4.7
Atad2bE9Q166 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC44.43■■■■■ 4.7
Atad2bE9Q166 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC44.42■■■■■ 4.7
Atad2bE9Q166 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC44.4■■■■■ 4.7
Atad2bE9Q166 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC44.4■■■■■ 4.7
Atad2bE9Q166 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.39■■■■■ 4.7
Atad2bE9Q166 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC44.39■■■■■ 4.7
Atad2bE9Q166 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC44.38■■■■■ 4.7
Atad2bE9Q166 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC44.38■■■■■ 4.69
Atad2bE9Q166 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.38■■■■■ 4.69
Atad2bE9Q166 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC44.36■■■■■ 4.69
Atad2bE9Q166 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC44.32■■■■■ 4.69
Atad2bE9Q166 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.32■■■■■ 4.68
Atad2bE9Q166 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC44.32■■■■■ 4.68
Atad2bE9Q166 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.31■■■■■ 4.68
Atad2bE9Q166 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.29■■■■■ 4.68
Atad2bE9Q166 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.29■■■■■ 4.68
Atad2bE9Q166 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC44.29■■■■■ 4.68
Atad2bE9Q166 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC44.29■■■■■ 4.68
Atad2bE9Q166 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC44.27■■■■■ 4.68
Atad2bE9Q166 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC44.26■■■■■ 4.68
Atad2bE9Q166 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC44.26■■■■■ 4.68
Atad2bE9Q166 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC44.26■■■■■ 4.68
Atad2bE9Q166 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.26■■■■■ 4.68
Atad2bE9Q166 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC44.26■■■■■ 4.68
Atad2bE9Q166 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.26■■■■■ 4.68
Atad2bE9Q166 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC44.25■■■■■ 4.67
Atad2bE9Q166 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC44.23■■■■■ 4.67
Atad2bE9Q166 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC44.22■■■■■ 4.67
Atad2bE9Q166 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.21■■■■■ 4.67
Atad2bE9Q166 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.21■■■■■ 4.67
Atad2bE9Q166 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC44.2■■■■■ 4.67
Atad2bE9Q166 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.19■■■■■ 4.66
Atad2bE9Q166 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC44.17■■■■■ 4.66
Atad2bE9Q166 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC44.16■■■■■ 4.66
Atad2bE9Q166 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC44.16■■■■■ 4.66
Atad2bE9Q166 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC44.16■■■■■ 4.66
Atad2bE9Q166 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC44.16■■■■■ 4.66
Atad2bE9Q166 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC44.16■■■■■ 4.66
Atad2bE9Q166 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.16■■■■■ 4.66
Atad2bE9Q166 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC44.15■■■■■ 4.66
Atad2bE9Q166 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.15■■■■■ 4.66
Atad2bE9Q166 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.14■■■■■ 4.66
Atad2bE9Q166 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.13■■■■■ 4.65
Atad2bE9Q166 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC44.11■■■■■ 4.65
Atad2bE9Q166 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC44.08■■■■■ 4.65
Atad2bE9Q166 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC44.07■■■■■ 4.65
Atad2bE9Q166 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.06■■■■■ 4.64
Atad2bE9Q166 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.06■■■■■ 4.64
Atad2bE9Q166 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC44.06■■■■■ 4.64
Atad2bE9Q166 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.06■■■■■ 4.64
Atad2bE9Q166 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.05■■■■■ 4.64
Atad2bE9Q166 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC44.05■■■■■ 4.64
Atad2bE9Q166 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.04■■■■■ 4.64
Atad2bE9Q166 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC44.04■■■■■ 4.64
Atad2bE9Q166 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.04■■■■■ 4.64
Atad2bE9Q166 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.03■■■■■ 4.64
Atad2bE9Q166 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC44.02■■■■■ 4.64
Atad2bE9Q166 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC44.01■■■■■ 4.64
Atad2bE9Q166 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC44■■■■■ 4.63
Atad2bE9Q166 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC44■■■■■ 4.63
Atad2bE9Q166 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44■■■■■ 4.63
Atad2bE9Q166 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.99■■■■■ 4.63
Atad2bE9Q166 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.99■■■■■ 4.63
Atad2bE9Q166 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.98■■■■■ 4.63
Atad2bE9Q166 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.97■■■■■ 4.63
Atad2bE9Q166 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC43.97■■■■■ 4.63
Atad2bE9Q166 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.96■■■■■ 4.63
Atad2bE9Q166 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC43.95■■■■■ 4.63
Atad2bE9Q166 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.95■■■■■ 4.63
Atad2bE9Q166 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC43.94■■■■■ 4.62
Atad2bE9Q166 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC43.93■■■■■ 4.62
Atad2bE9Q166 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC43.92■■■■■ 4.62
Atad2bE9Q166 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC43.92■■■■■ 4.62
Atad2bE9Q166 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC43.92■■■■■ 4.62
Atad2bE9Q166 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.92■■■■■ 4.62
Atad2bE9Q166 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC43.91■■■■■ 4.62
Atad2bE9Q166 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC43.9■■■■■ 4.62
Atad2bE9Q166 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC43.9■■■■■ 4.62
Atad2bE9Q166 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC43.89■■■■■ 4.62
Atad2bE9Q166 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.89■■■■■ 4.62
Atad2bE9Q166 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC43.89■■■■■ 4.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.4 ms