Protein–RNA interactions for Protein: E9Q043

Fndc1, Fibronectin type III domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,732 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc1E9Q043 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC37.71■■■■□ 3.63
Fndc1E9Q043 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.7■■■■□ 3.63
Fndc1E9Q043 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC37.7■■■■□ 3.63
Fndc1E9Q043 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.69■■■■□ 3.62
Fndc1E9Q043 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.69■■■■□ 3.62
Fndc1E9Q043 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC37.69■■■■□ 3.62
Fndc1E9Q043 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC37.68■■■■□ 3.62
Fndc1E9Q043 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
Fndc1E9Q043 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
Fndc1E9Q043 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC37.67■■■■□ 3.62
Fndc1E9Q043 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.67■■■■□ 3.62
Fndc1E9Q043 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.67■■■■□ 3.62
Fndc1E9Q043 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC37.65■■■■□ 3.62
Fndc1E9Q043 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.64■■■■□ 3.62
Fndc1E9Q043 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.63■■■■□ 3.61
Fndc1E9Q043 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.62■■■■□ 3.61
Fndc1E9Q043 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.62■■■■□ 3.61
Fndc1E9Q043 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC37.61■■■■□ 3.61
Fndc1E9Q043 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.6■■■■□ 3.61
Fndc1E9Q043 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.6■■■■□ 3.61
Fndc1E9Q043 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC37.58■■■■□ 3.61
Fndc1E9Q043 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC37.58■■■■□ 3.61
Fndc1E9Q043 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC37.57■■■■□ 3.6
Fndc1E9Q043 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.57■■■■□ 3.6
Fndc1E9Q043 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC37.56■■■■□ 3.6
Fndc1E9Q043 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC37.56■■■■□ 3.6
Fndc1E9Q043 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.56■■■■□ 3.6
Fndc1E9Q043 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC37.56■■■■□ 3.6
Fndc1E9Q043 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.56■■■■□ 3.6
Fndc1E9Q043 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC37.55■■■■□ 3.6
Fndc1E9Q043 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC37.54■■■■□ 3.6
Fndc1E9Q043 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC37.52■■■■□ 3.6
Fndc1E9Q043 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC37.51■■■■□ 3.6
Fndc1E9Q043 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC37.51■■■■□ 3.6
Fndc1E9Q043 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.51■■■■□ 3.6
Fndc1E9Q043 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.6
Fndc1E9Q043 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
Fndc1E9Q043 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC37.5■■■■□ 3.59
Fndc1E9Q043 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC37.5■■■■□ 3.59
Fndc1E9Q043 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC37.5■■■■□ 3.59
Fndc1E9Q043 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
Fndc1E9Q043 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC37.5■■■■□ 3.59
Fndc1E9Q043 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC37.5■■■■□ 3.59
Fndc1E9Q043 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC37.49■■■■□ 3.59
Fndc1E9Q043 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.48■■■■□ 3.59
Fndc1E9Q043 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC37.47■■■■□ 3.59
Fndc1E9Q043 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.47■■■■□ 3.59
Fndc1E9Q043 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.46■■■■□ 3.59
Fndc1E9Q043 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC37.45■■■■□ 3.59
Fndc1E9Q043 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC37.44■■■■□ 3.58
Fndc1E9Q043 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.44■■■■□ 3.58
Fndc1E9Q043 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.4■■■■□ 3.58
Fndc1E9Q043 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.39■■■■□ 3.58
Fndc1E9Q043 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.39■■■■□ 3.58
Fndc1E9Q043 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC37.39■■■■□ 3.58
Fndc1E9Q043 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.39■■■■□ 3.58
Fndc1E9Q043 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.39■■■■□ 3.58
Fndc1E9Q043 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.38■■■■□ 3.58
Fndc1E9Q043 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC37.36■■■■□ 3.57
Fndc1E9Q043 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC37.35■■■■□ 3.57
Fndc1E9Q043 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.35■■■■□ 3.57
Fndc1E9Q043 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.35■■■■□ 3.57
Fndc1E9Q043 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC37.34■■■■□ 3.57
Fndc1E9Q043 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC37.33■■■■□ 3.57
Fndc1E9Q043 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.56
Fndc1E9Q043 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC37.31■■■■□ 3.56
Fndc1E9Q043 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC37.31■■■■□ 3.56
Fndc1E9Q043 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC37.3■■■■□ 3.56
Fndc1E9Q043 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
Fndc1E9Q043 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
Fndc1E9Q043 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
Fndc1E9Q043 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.26■■■■□ 3.56
Fndc1E9Q043 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
Fndc1E9Q043 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
Fndc1E9Q043 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
Fndc1E9Q043 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC37.23■■■■□ 3.55
Fndc1E9Q043 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC37.22■■■■□ 3.55
Fndc1E9Q043 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
Fndc1E9Q043 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC37.22■■■■□ 3.55
Fndc1E9Q043 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
Fndc1E9Q043 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
Fndc1E9Q043 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
Fndc1E9Q043 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
Fndc1E9Q043 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
Fndc1E9Q043 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC37.17■■■■□ 3.54
Fndc1E9Q043 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
Fndc1E9Q043 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC37.16■■■■□ 3.54
Fndc1E9Q043 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
Fndc1E9Q043 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC37.16■■■■□ 3.54
Fndc1E9Q043 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
Fndc1E9Q043 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
Fndc1E9Q043 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC37.13■■■■□ 3.54
Fndc1E9Q043 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.54
Fndc1E9Q043 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC37.12■■■■□ 3.53
Fndc1E9Q043 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
Fndc1E9Q043 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
Fndc1E9Q043 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC37.11■■■■□ 3.53
Fndc1E9Q043 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
Fndc1E9Q043 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC37.09■■■■□ 3.53
Fndc1E9Q043 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms