Protein–RNA interactions for Protein: E9PZ54

Gcom1, GRINL1A complex locus, mousemouse

Predictions only

Length 550 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gcom1E9PZ54 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Gcom1E9PZ54 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Gcom1E9PZ54 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Gcom1E9PZ54 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Gcom1E9PZ54 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Gcom1E9PZ54 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Gcom1E9PZ54 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Gcom1E9PZ54 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Gcom1E9PZ54 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Gcom1E9PZ54 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Gcom1E9PZ54 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Gcom1E9PZ54 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Gcom1E9PZ54 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Gcom1E9PZ54 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Gcom1E9PZ54 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Gcom1E9PZ54 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Gcom1E9PZ54 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Gcom1E9PZ54 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Gcom1E9PZ54 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Gcom1E9PZ54 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Gcom1E9PZ54 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Gcom1E9PZ54 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Gcom1E9PZ54 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Gcom1E9PZ54 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Gcom1E9PZ54 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Gcom1E9PZ54 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Gcom1E9PZ54 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Gcom1E9PZ54 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Gcom1E9PZ54 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Gcom1E9PZ54 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Gcom1E9PZ54 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Gcom1E9PZ54 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Gcom1E9PZ54 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Gcom1E9PZ54 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Gcom1E9PZ54 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Gcom1E9PZ54 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Gcom1E9PZ54 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Gcom1E9PZ54 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Gcom1E9PZ54 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Gcom1E9PZ54 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Gcom1E9PZ54 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Gcom1E9PZ54 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Gcom1E9PZ54 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Gcom1E9PZ54 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Gcom1E9PZ54 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Gcom1E9PZ54 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Gcom1E9PZ54 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Gcom1E9PZ54 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
Gcom1E9PZ54 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Gcom1E9PZ54 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
Gcom1E9PZ54 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Gcom1E9PZ54 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Gcom1E9PZ54 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Gcom1E9PZ54 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Gcom1E9PZ54 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Gcom1E9PZ54 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Gcom1E9PZ54 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Gcom1E9PZ54 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Gcom1E9PZ54 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Gcom1E9PZ54 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Gcom1E9PZ54 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Gcom1E9PZ54 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Gcom1E9PZ54 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Gcom1E9PZ54 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Gcom1E9PZ54 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Gcom1E9PZ54 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Gcom1E9PZ54 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Gcom1E9PZ54 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Gcom1E9PZ54 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Gcom1E9PZ54 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Gcom1E9PZ54 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Gcom1E9PZ54 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Gcom1E9PZ54 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Gcom1E9PZ54 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Gcom1E9PZ54 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Gcom1E9PZ54 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Gcom1E9PZ54 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Gcom1E9PZ54 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Gcom1E9PZ54 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Gcom1E9PZ54 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Gcom1E9PZ54 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Gcom1E9PZ54 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Gcom1E9PZ54 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Gcom1E9PZ54 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Gcom1E9PZ54 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Gcom1E9PZ54 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Gcom1E9PZ54 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Gcom1E9PZ54 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Gcom1E9PZ54 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Gcom1E9PZ54 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Gcom1E9PZ54 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Gcom1E9PZ54 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Gcom1E9PZ54 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Gcom1E9PZ54 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Gcom1E9PZ54 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Gcom1E9PZ54 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Gcom1E9PZ54 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Gcom1E9PZ54 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Gcom1E9PZ54 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
Gcom1E9PZ54 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms