Protein–RNA interactions for Protein: E9PXB6

Sfta2, Surfactant-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 77 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfta2E9PXB6 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sfta2E9PXB6 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sfta2E9PXB6 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sfta2E9PXB6 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sfta2E9PXB6 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Sfta2E9PXB6 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sfta2E9PXB6 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sfta2E9PXB6 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sfta2E9PXB6 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sfta2E9PXB6 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sfta2E9PXB6 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sfta2E9PXB6 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sfta2E9PXB6 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Sfta2E9PXB6 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sfta2E9PXB6 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sfta2E9PXB6 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sfta2E9PXB6 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sfta2E9PXB6 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sfta2E9PXB6 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sfta2E9PXB6 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sfta2E9PXB6 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sfta2E9PXB6 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sfta2E9PXB6 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sfta2E9PXB6 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sfta2E9PXB6 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sfta2E9PXB6 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sfta2E9PXB6 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sfta2E9PXB6 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sfta2E9PXB6 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sfta2E9PXB6 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sfta2E9PXB6 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sfta2E9PXB6 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sfta2E9PXB6 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sfta2E9PXB6 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Sfta2E9PXB6 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Sfta2E9PXB6 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sfta2E9PXB6 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sfta2E9PXB6 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sfta2E9PXB6 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sfta2E9PXB6 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sfta2E9PXB6 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sfta2E9PXB6 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sfta2E9PXB6 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sfta2E9PXB6 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sfta2E9PXB6 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sfta2E9PXB6 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sfta2E9PXB6 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sfta2E9PXB6 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sfta2E9PXB6 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Sfta2E9PXB6 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sfta2E9PXB6 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sfta2E9PXB6 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sfta2E9PXB6 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sfta2E9PXB6 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sfta2E9PXB6 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sfta2E9PXB6 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sfta2E9PXB6 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sfta2E9PXB6 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sfta2E9PXB6 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sfta2E9PXB6 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sfta2E9PXB6 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Sfta2E9PXB6 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sfta2E9PXB6 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sfta2E9PXB6 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sfta2E9PXB6 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sfta2E9PXB6 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sfta2E9PXB6 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sfta2E9PXB6 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sfta2E9PXB6 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sfta2E9PXB6 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sfta2E9PXB6 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sfta2E9PXB6 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sfta2E9PXB6 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sfta2E9PXB6 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sfta2E9PXB6 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sfta2E9PXB6 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sfta2E9PXB6 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sfta2E9PXB6 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sfta2E9PXB6 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sfta2E9PXB6 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sfta2E9PXB6 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sfta2E9PXB6 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sfta2E9PXB6 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sfta2E9PXB6 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sfta2E9PXB6 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sfta2E9PXB6 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sfta2E9PXB6 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sfta2E9PXB6 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sfta2E9PXB6 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sfta2E9PXB6 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sfta2E9PXB6 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sfta2E9PXB6 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Sfta2E9PXB6 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sfta2E9PXB6 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sfta2E9PXB6 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sfta2E9PXB6 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sfta2E9PXB6 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sfta2E9PXB6 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sfta2E9PXB6 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sfta2E9PXB6 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms