Protein–RNA interactions for Protein: E1AZ71

Cngb1, Cyclic nucleotide-gated channel beta 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cngb1E1AZ71 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC41.84■■■■■ 4.29
Cngb1E1AZ71 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.84■■■■■ 4.29
Cngb1E1AZ71 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC41.84■■■■■ 4.29
Cngb1E1AZ71 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC41.83■■■■■ 4.29
Cngb1E1AZ71 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC41.81■■■■■ 4.28
Cngb1E1AZ71 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.79■■■■■ 4.28
Cngb1E1AZ71 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.78■■■■■ 4.28
Cngb1E1AZ71 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC41.78■■■■■ 4.28
Cngb1E1AZ71 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.77■■■■■ 4.28
Cngb1E1AZ71 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC41.76■■■■■ 4.28
Cngb1E1AZ71 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC41.74■■■■■ 4.27
Cngb1E1AZ71 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC41.72■■■■■ 4.27
Cngb1E1AZ71 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.7■■■■■ 4.27
Cngb1E1AZ71 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC41.69■■■■■ 4.27
Cngb1E1AZ71 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.69■■■■■ 4.26
Cngb1E1AZ71 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.68■■■■■ 4.26
Cngb1E1AZ71 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC41.67■■■■■ 4.26
Cngb1E1AZ71 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC41.67■■■■■ 4.26
Cngb1E1AZ71 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC41.66■■■■■ 4.26
Cngb1E1AZ71 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.66■■■■■ 4.26
Cngb1E1AZ71 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.65■■■■■ 4.26
Cngb1E1AZ71 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC41.65■■■■■ 4.26
Cngb1E1AZ71 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC41.65■■■■■ 4.26
Cngb1E1AZ71 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC41.65■■■■■ 4.26
Cngb1E1AZ71 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.63■■■■■ 4.26
Cngb1E1AZ71 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC41.63■■■■■ 4.26
Cngb1E1AZ71 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC41.63■■■■■ 4.25
Cngb1E1AZ71 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC41.63■■■■■ 4.25
Cngb1E1AZ71 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC41.6■■■■■ 4.25
Cngb1E1AZ71 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC41.59■■■■■ 4.25
Cngb1E1AZ71 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.58■■■■■ 4.25
Cngb1E1AZ71 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC41.58■■■■■ 4.25
Cngb1E1AZ71 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC41.57■■■■■ 4.25
Cngb1E1AZ71 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC41.57■■■■■ 4.25
Cngb1E1AZ71 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC41.56■■■■■ 4.24
Cngb1E1AZ71 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.55■■■■■ 4.24
Cngb1E1AZ71 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC41.54■■■■■ 4.24
Cngb1E1AZ71 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC41.53■■■■■ 4.24
Cngb1E1AZ71 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.53■■■■■ 4.24
Cngb1E1AZ71 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC41.52■■■■■ 4.24
Cngb1E1AZ71 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC41.51■■■■■ 4.24
Cngb1E1AZ71 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC41.51■■■■■ 4.24
Cngb1E1AZ71 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC41.49■■■■■ 4.23
Cngb1E1AZ71 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.48■■■■■ 4.23
Cngb1E1AZ71 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC41.47■■■■■ 4.23
Cngb1E1AZ71 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC41.46■■■■■ 4.23
Cngb1E1AZ71 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.46■■■■■ 4.23
Cngb1E1AZ71 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC41.45■■■■■ 4.23
Cngb1E1AZ71 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC41.44■■■■■ 4.23
Cngb1E1AZ71 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.43■■■■■ 4.22
Cngb1E1AZ71 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC41.42■■■■■ 4.22
Cngb1E1AZ71 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC41.4■■■■■ 4.22
Cngb1E1AZ71 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC41.39■■■■■ 4.22
Cngb1E1AZ71 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.36■■■■■ 4.21
Cngb1E1AZ71 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC41.36■■■■■ 4.21
Cngb1E1AZ71 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC41.36■■■■■ 4.21
Cngb1E1AZ71 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC41.34■■■■■ 4.21
Cngb1E1AZ71 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.33■■■■■ 4.21
Cngb1E1AZ71 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC41.33■■■■■ 4.21
Cngb1E1AZ71 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC41.33■■■■■ 4.21
Cngb1E1AZ71 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC41.33■■■■■ 4.21
Cngb1E1AZ71 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC41.32■■■■■ 4.21
Cngb1E1AZ71 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC41.32■■■■■ 4.21
Cngb1E1AZ71 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC41.32■■■■■ 4.21
Cngb1E1AZ71 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC41.31■■■■■ 4.2
Cngb1E1AZ71 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.3■■■■■ 4.2
Cngb1E1AZ71 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.3■■■■■ 4.2
Cngb1E1AZ71 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.29■■■■■ 4.2
Cngb1E1AZ71 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.29■■■■■ 4.2
Cngb1E1AZ71 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.29■■■■■ 4.2
Cngb1E1AZ71 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC41.29■■■■■ 4.2
Cngb1E1AZ71 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.28■■■■■ 4.2
Cngb1E1AZ71 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.26■■■■■ 4.2
Cngb1E1AZ71 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC41.26■■■■■ 4.2
Cngb1E1AZ71 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.25■■■■■ 4.19
Cngb1E1AZ71 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.25■■■■■ 4.19
Cngb1E1AZ71 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.24■■■■■ 4.19
Cngb1E1AZ71 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC41.24■■■■■ 4.19
Cngb1E1AZ71 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.24■■■■■ 4.19
Cngb1E1AZ71 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC41.23■■■■■ 4.19
Cngb1E1AZ71 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.21■■■■■ 4.19
Cngb1E1AZ71 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC41.21■■■■■ 4.19
Cngb1E1AZ71 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC41.2■■■■■ 4.19
Cngb1E1AZ71 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC41.18■■■■■ 4.18
Cngb1E1AZ71 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.18■■■■■ 4.18
Cngb1E1AZ71 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC41.16■■■■■ 4.18
Cngb1E1AZ71 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC41.15■■■■■ 4.18
Cngb1E1AZ71 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC41.15■■■■■ 4.18
Cngb1E1AZ71 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC41.14■■■■■ 4.18
Cngb1E1AZ71 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.14■■■■■ 4.18
Cngb1E1AZ71 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC41.14■■■■■ 4.18
Cngb1E1AZ71 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.13■■■■■ 4.17
Cngb1E1AZ71 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.13■■■■■ 4.17
Cngb1E1AZ71 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC41.13■■■■■ 4.17
Cngb1E1AZ71 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC41.13■■■■■ 4.17
Cngb1E1AZ71 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC41.12■■■■■ 4.17
Cngb1E1AZ71 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC41.12■■■■■ 4.17
Cngb1E1AZ71 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.12■■■■■ 4.17
Cngb1E1AZ71 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.11■■■■■ 4.17
Cngb1E1AZ71 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.09■■■■■ 4.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms