Protein–RNA interactions for Protein: D3Z741

4930444G20Rik, RIKEN cDNA 4930444G20 gene, mousemouse

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930444G20RikD3Z741 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
4930444G20RikD3Z741 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
4930444G20RikD3Z741 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
4930444G20RikD3Z741 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
4930444G20RikD3Z741 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
4930444G20RikD3Z741 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
4930444G20RikD3Z741 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
4930444G20RikD3Z741 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
4930444G20RikD3Z741 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
4930444G20RikD3Z741 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
4930444G20RikD3Z741 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
4930444G20RikD3Z741 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
4930444G20RikD3Z741 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
4930444G20RikD3Z741 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
4930444G20RikD3Z741 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
4930444G20RikD3Z741 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
4930444G20RikD3Z741 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
4930444G20RikD3Z741 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
4930444G20RikD3Z741 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
4930444G20RikD3Z741 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
4930444G20RikD3Z741 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
4930444G20RikD3Z741 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
4930444G20RikD3Z741 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
4930444G20RikD3Z741 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
4930444G20RikD3Z741 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
4930444G20RikD3Z741 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
4930444G20RikD3Z741 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
4930444G20RikD3Z741 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
4930444G20RikD3Z741 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
4930444G20RikD3Z741 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
4930444G20RikD3Z741 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
4930444G20RikD3Z741 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
4930444G20RikD3Z741 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
4930444G20RikD3Z741 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
4930444G20RikD3Z741 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
4930444G20RikD3Z741 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
4930444G20RikD3Z741 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
4930444G20RikD3Z741 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
4930444G20RikD3Z741 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.39■■□□□ 1.66
4930444G20RikD3Z741 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
4930444G20RikD3Z741 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
4930444G20RikD3Z741 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
4930444G20RikD3Z741 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
4930444G20RikD3Z741 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
4930444G20RikD3Z741 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
4930444G20RikD3Z741 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
4930444G20RikD3Z741 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
4930444G20RikD3Z741 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
4930444G20RikD3Z741 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
4930444G20RikD3Z741 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
4930444G20RikD3Z741 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
4930444G20RikD3Z741 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
4930444G20RikD3Z741 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
4930444G20RikD3Z741 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
4930444G20RikD3Z741 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
4930444G20RikD3Z741 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
4930444G20RikD3Z741 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
4930444G20RikD3Z741 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
4930444G20RikD3Z741 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
4930444G20RikD3Z741 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
4930444G20RikD3Z741 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
4930444G20RikD3Z741 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
4930444G20RikD3Z741 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
4930444G20RikD3Z741 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
4930444G20RikD3Z741 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
4930444G20RikD3Z741 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
4930444G20RikD3Z741 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
4930444G20RikD3Z741 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
4930444G20RikD3Z741 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
4930444G20RikD3Z741 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
4930444G20RikD3Z741 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
4930444G20RikD3Z741 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
4930444G20RikD3Z741 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
4930444G20RikD3Z741 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
4930444G20RikD3Z741 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
4930444G20RikD3Z741 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
4930444G20RikD3Z741 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
4930444G20RikD3Z741 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
4930444G20RikD3Z741 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
4930444G20RikD3Z741 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
4930444G20RikD3Z741 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
4930444G20RikD3Z741 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
4930444G20RikD3Z741 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
4930444G20RikD3Z741 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
4930444G20RikD3Z741 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
4930444G20RikD3Z741 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
4930444G20RikD3Z741 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
4930444G20RikD3Z741 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
4930444G20RikD3Z741 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
4930444G20RikD3Z741 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
4930444G20RikD3Z741 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
4930444G20RikD3Z741 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
4930444G20RikD3Z741 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
4930444G20RikD3Z741 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
4930444G20RikD3Z741 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
4930444G20RikD3Z741 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
4930444G20RikD3Z741 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
4930444G20RikD3Z741 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
4930444G20RikD3Z741 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
4930444G20RikD3Z741 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms