Protein–RNA interactions for Protein: D3Z3C6

Zfand4, AN1-type zinc finger protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 739 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfand4D3Z3C6 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Zfand4D3Z3C6 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
Zfand4D3Z3C6 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Zfand4D3Z3C6 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Zfand4D3Z3C6 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Zfand4D3Z3C6 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Zfand4D3Z3C6 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Zfand4D3Z3C6 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Zfand4D3Z3C6 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Zfand4D3Z3C6 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Zfand4D3Z3C6 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Zfand4D3Z3C6 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Zfand4D3Z3C6 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Zfand4D3Z3C6 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Zfand4D3Z3C6 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Zfand4D3Z3C6 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Zfand4D3Z3C6 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Zfand4D3Z3C6 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Zfand4D3Z3C6 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Zfand4D3Z3C6 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Zfand4D3Z3C6 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Zfand4D3Z3C6 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
Zfand4D3Z3C6 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Zfand4D3Z3C6 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
Zfand4D3Z3C6 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Zfand4D3Z3C6 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Zfand4D3Z3C6 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Zfand4D3Z3C6 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Zfand4D3Z3C6 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
Zfand4D3Z3C6 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
Zfand4D3Z3C6 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Zfand4D3Z3C6 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Zfand4D3Z3C6 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Zfand4D3Z3C6 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Zfand4D3Z3C6 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Zfand4D3Z3C6 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Zfand4D3Z3C6 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Zfand4D3Z3C6 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Zfand4D3Z3C6 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Zfand4D3Z3C6 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Zfand4D3Z3C6 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Zfand4D3Z3C6 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Zfand4D3Z3C6 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Zfand4D3Z3C6 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Zfand4D3Z3C6 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Zfand4D3Z3C6 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Zfand4D3Z3C6 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Zfand4D3Z3C6 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Zfand4D3Z3C6 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Zfand4D3Z3C6 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Zfand4D3Z3C6 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Zfand4D3Z3C6 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Zfand4D3Z3C6 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Zfand4D3Z3C6 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Zfand4D3Z3C6 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Zfand4D3Z3C6 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Zfand4D3Z3C6 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Zfand4D3Z3C6 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Zfand4D3Z3C6 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Zfand4D3Z3C6 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Zfand4D3Z3C6 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Zfand4D3Z3C6 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Zfand4D3Z3C6 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Zfand4D3Z3C6 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Zfand4D3Z3C6 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Zfand4D3Z3C6 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Zfand4D3Z3C6 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Zfand4D3Z3C6 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
Zfand4D3Z3C6 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Zfand4D3Z3C6 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Zfand4D3Z3C6 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
Zfand4D3Z3C6 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
Zfand4D3Z3C6 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Zfand4D3Z3C6 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Zfand4D3Z3C6 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Zfand4D3Z3C6 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
Zfand4D3Z3C6 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Zfand4D3Z3C6 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Zfand4D3Z3C6 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Zfand4D3Z3C6 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Zfand4D3Z3C6 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Zfand4D3Z3C6 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Zfand4D3Z3C6 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Zfand4D3Z3C6 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Zfand4D3Z3C6 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Zfand4D3Z3C6 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Zfand4D3Z3C6 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Zfand4D3Z3C6 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Zfand4D3Z3C6 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Zfand4D3Z3C6 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Zfand4D3Z3C6 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Zfand4D3Z3C6 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Zfand4D3Z3C6 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Zfand4D3Z3C6 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Zfand4D3Z3C6 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Zfand4D3Z3C6 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Zfand4D3Z3C6 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Zfand4D3Z3C6 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Zfand4D3Z3C6 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Zfand4D3Z3C6 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms