Protein–RNA interactions for Protein: D3Z1H5

Cd209f, CD209f antigen, mousemouse

Predictions only

Length 274 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd209fD3Z1H5 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cd209fD3Z1H5 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cd209fD3Z1H5 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cd209fD3Z1H5 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cd209fD3Z1H5 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cd209fD3Z1H5 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cd209fD3Z1H5 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cd209fD3Z1H5 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cd209fD3Z1H5 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cd209fD3Z1H5 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cd209fD3Z1H5 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cd209fD3Z1H5 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cd209fD3Z1H5 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cd209fD3Z1H5 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cd209fD3Z1H5 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Cd209fD3Z1H5 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cd209fD3Z1H5 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cd209fD3Z1H5 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cd209fD3Z1H5 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cd209fD3Z1H5 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cd209fD3Z1H5 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cd209fD3Z1H5 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cd209fD3Z1H5 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cd209fD3Z1H5 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cd209fD3Z1H5 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cd209fD3Z1H5 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cd209fD3Z1H5 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cd209fD3Z1H5 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Cd209fD3Z1H5 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cd209fD3Z1H5 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Cd209fD3Z1H5 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cd209fD3Z1H5 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cd209fD3Z1H5 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Cd209fD3Z1H5 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cd209fD3Z1H5 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cd209fD3Z1H5 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cd209fD3Z1H5 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cd209fD3Z1H5 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cd209fD3Z1H5 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cd209fD3Z1H5 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cd209fD3Z1H5 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cd209fD3Z1H5 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cd209fD3Z1H5 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cd209fD3Z1H5 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cd209fD3Z1H5 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cd209fD3Z1H5 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cd209fD3Z1H5 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cd209fD3Z1H5 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cd209fD3Z1H5 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cd209fD3Z1H5 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cd209fD3Z1H5 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cd209fD3Z1H5 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Cd209fD3Z1H5 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cd209fD3Z1H5 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cd209fD3Z1H5 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Cd209fD3Z1H5 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cd209fD3Z1H5 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cd209fD3Z1H5 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cd209fD3Z1H5 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cd209fD3Z1H5 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cd209fD3Z1H5 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cd209fD3Z1H5 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cd209fD3Z1H5 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cd209fD3Z1H5 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cd209fD3Z1H5 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cd209fD3Z1H5 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cd209fD3Z1H5 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cd209fD3Z1H5 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cd209fD3Z1H5 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cd209fD3Z1H5 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cd209fD3Z1H5 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cd209fD3Z1H5 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cd209fD3Z1H5 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cd209fD3Z1H5 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cd209fD3Z1H5 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cd209fD3Z1H5 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cd209fD3Z1H5 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cd209fD3Z1H5 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cd209fD3Z1H5 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cd209fD3Z1H5 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cd209fD3Z1H5 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cd209fD3Z1H5 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cd209fD3Z1H5 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cd209fD3Z1H5 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cd209fD3Z1H5 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Cd209fD3Z1H5 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cd209fD3Z1H5 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cd209fD3Z1H5 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cd209fD3Z1H5 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Cd209fD3Z1H5 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cd209fD3Z1H5 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cd209fD3Z1H5 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cd209fD3Z1H5 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cd209fD3Z1H5 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cd209fD3Z1H5 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cd209fD3Z1H5 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cd209fD3Z1H5 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cd209fD3Z1H5 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cd209fD3Z1H5 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cd209fD3Z1H5 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms