Protein–RNA interactions for Protein: D3Z0W7

Gm4871, MCG126741, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm4871D3Z0W7 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Gm4871D3Z0W7 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Gm4871D3Z0W7 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Gm4871D3Z0W7 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Gm4871D3Z0W7 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Gm4871D3Z0W7 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Gm4871D3Z0W7 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Gm4871D3Z0W7 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Gm4871D3Z0W7 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Gm4871D3Z0W7 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Gm4871D3Z0W7 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Gm4871D3Z0W7 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Gm4871D3Z0W7 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Gm4871D3Z0W7 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gm4871D3Z0W7 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gm4871D3Z0W7 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gm4871D3Z0W7 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Gm4871D3Z0W7 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Gm4871D3Z0W7 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Gm4871D3Z0W7 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Gm4871D3Z0W7 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Gm4871D3Z0W7 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Gm4871D3Z0W7 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Gm4871D3Z0W7 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Gm4871D3Z0W7 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Gm4871D3Z0W7 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Gm4871D3Z0W7 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Gm4871D3Z0W7 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gm4871D3Z0W7 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gm4871D3Z0W7 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gm4871D3Z0W7 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Gm4871D3Z0W7 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gm4871D3Z0W7 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gm4871D3Z0W7 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gm4871D3Z0W7 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Gm4871D3Z0W7 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gm4871D3Z0W7 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Gm4871D3Z0W7 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gm4871D3Z0W7 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gm4871D3Z0W7 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gm4871D3Z0W7 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gm4871D3Z0W7 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gm4871D3Z0W7 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gm4871D3Z0W7 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gm4871D3Z0W7 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gm4871D3Z0W7 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gm4871D3Z0W7 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gm4871D3Z0W7 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Gm4871D3Z0W7 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gm4871D3Z0W7 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gm4871D3Z0W7 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gm4871D3Z0W7 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gm4871D3Z0W7 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gm4871D3Z0W7 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gm4871D3Z0W7 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gm4871D3Z0W7 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gm4871D3Z0W7 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gm4871D3Z0W7 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gm4871D3Z0W7 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Gm4871D3Z0W7 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gm4871D3Z0W7 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gm4871D3Z0W7 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gm4871D3Z0W7 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gm4871D3Z0W7 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Gm4871D3Z0W7 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gm4871D3Z0W7 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gm4871D3Z0W7 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gm4871D3Z0W7 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gm4871D3Z0W7 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gm4871D3Z0W7 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gm4871D3Z0W7 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gm4871D3Z0W7 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gm4871D3Z0W7 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gm4871D3Z0W7 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gm4871D3Z0W7 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gm4871D3Z0W7 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gm4871D3Z0W7 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gm4871D3Z0W7 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Gm4871D3Z0W7 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Gm4871D3Z0W7 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gm4871D3Z0W7 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gm4871D3Z0W7 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gm4871D3Z0W7 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gm4871D3Z0W7 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Gm4871D3Z0W7 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gm4871D3Z0W7 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gm4871D3Z0W7 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gm4871D3Z0W7 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gm4871D3Z0W7 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Gm4871D3Z0W7 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gm4871D3Z0W7 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gm4871D3Z0W7 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gm4871D3Z0W7 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gm4871D3Z0W7 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gm4871D3Z0W7 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Gm4871D3Z0W7 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gm4871D3Z0W7 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gm4871D3Z0W7 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gm4871D3Z0W7 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gm4871D3Z0W7 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms