Protein–RNA interactions for Protein: D3YVI9

Trim30c, Tripartite motif-containing 30C, mousemouse

Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim30cD3YVI9 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Trim30cD3YVI9 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Trim30cD3YVI9 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Trim30cD3YVI9 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
Trim30cD3YVI9 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Trim30cD3YVI9 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Trim30cD3YVI9 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Trim30cD3YVI9 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Trim30cD3YVI9 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Trim30cD3YVI9 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Trim30cD3YVI9 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Trim30cD3YVI9 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Trim30cD3YVI9 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Trim30cD3YVI9 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Trim30cD3YVI9 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Trim30cD3YVI9 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Trim30cD3YVI9 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Trim30cD3YVI9 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Trim30cD3YVI9 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Trim30cD3YVI9 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Trim30cD3YVI9 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Trim30cD3YVI9 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Trim30cD3YVI9 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Trim30cD3YVI9 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Trim30cD3YVI9 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Trim30cD3YVI9 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Trim30cD3YVI9 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Trim30cD3YVI9 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Trim30cD3YVI9 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
Trim30cD3YVI9 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Trim30cD3YVI9 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Trim30cD3YVI9 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Trim30cD3YVI9 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Trim30cD3YVI9 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Trim30cD3YVI9 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Trim30cD3YVI9 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
Trim30cD3YVI9 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Trim30cD3YVI9 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Trim30cD3YVI9 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Trim30cD3YVI9 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Trim30cD3YVI9 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Trim30cD3YVI9 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Trim30cD3YVI9 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Trim30cD3YVI9 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Trim30cD3YVI9 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Trim30cD3YVI9 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Trim30cD3YVI9 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Trim30cD3YVI9 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Trim30cD3YVI9 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Trim30cD3YVI9 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Trim30cD3YVI9 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Trim30cD3YVI9 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Trim30cD3YVI9 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Trim30cD3YVI9 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Trim30cD3YVI9 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Trim30cD3YVI9 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Trim30cD3YVI9 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Trim30cD3YVI9 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Trim30cD3YVI9 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Trim30cD3YVI9 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Trim30cD3YVI9 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Trim30cD3YVI9 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Trim30cD3YVI9 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Trim30cD3YVI9 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Trim30cD3YVI9 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Trim30cD3YVI9 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Trim30cD3YVI9 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Trim30cD3YVI9 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Trim30cD3YVI9 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Trim30cD3YVI9 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
Trim30cD3YVI9 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Trim30cD3YVI9 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Trim30cD3YVI9 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Trim30cD3YVI9 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Trim30cD3YVI9 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Trim30cD3YVI9 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Trim30cD3YVI9 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
Trim30cD3YVI9 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Trim30cD3YVI9 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Trim30cD3YVI9 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Trim30cD3YVI9 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Trim30cD3YVI9 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Trim30cD3YVI9 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Trim30cD3YVI9 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Trim30cD3YVI9 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Trim30cD3YVI9 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Trim30cD3YVI9 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Trim30cD3YVI9 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Trim30cD3YVI9 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Trim30cD3YVI9 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Trim30cD3YVI9 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Trim30cD3YVI9 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Trim30cD3YVI9 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Trim30cD3YVI9 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Trim30cD3YVI9 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Trim30cD3YVI9 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Trim30cD3YVI9 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Trim30cD3YVI9 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Trim30cD3YVI9 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Trim30cD3YVI9 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms