Protein–RNA interactions for Protein: B2RT54

Apol7a, Apolipoprotein L 7a, mousemouse

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apol7aB2RT54 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
Apol7aB2RT54 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Apol7aB2RT54 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Apol7aB2RT54 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Apol7aB2RT54 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Apol7aB2RT54 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Apol7aB2RT54 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Apol7aB2RT54 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Apol7aB2RT54 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Apol7aB2RT54 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Apol7aB2RT54 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Apol7aB2RT54 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Apol7aB2RT54 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Apol7aB2RT54 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
Apol7aB2RT54 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Apol7aB2RT54 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Apol7aB2RT54 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Apol7aB2RT54 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Apol7aB2RT54 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
Apol7aB2RT54 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Apol7aB2RT54 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Apol7aB2RT54 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
Apol7aB2RT54 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Apol7aB2RT54 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Apol7aB2RT54 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Apol7aB2RT54 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Apol7aB2RT54 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Apol7aB2RT54 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Apol7aB2RT54 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Apol7aB2RT54 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Apol7aB2RT54 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Apol7aB2RT54 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Apol7aB2RT54 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Apol7aB2RT54 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Apol7aB2RT54 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Apol7aB2RT54 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
Apol7aB2RT54 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Apol7aB2RT54 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Apol7aB2RT54 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
Apol7aB2RT54 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Apol7aB2RT54 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Apol7aB2RT54 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Apol7aB2RT54 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
Apol7aB2RT54 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Apol7aB2RT54 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Apol7aB2RT54 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Apol7aB2RT54 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Apol7aB2RT54 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Apol7aB2RT54 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Apol7aB2RT54 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Apol7aB2RT54 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Apol7aB2RT54 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Apol7aB2RT54 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Apol7aB2RT54 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Apol7aB2RT54 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
Apol7aB2RT54 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Apol7aB2RT54 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Apol7aB2RT54 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Apol7aB2RT54 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Apol7aB2RT54 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Apol7aB2RT54 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Apol7aB2RT54 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Apol7aB2RT54 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Apol7aB2RT54 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Apol7aB2RT54 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Apol7aB2RT54 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Apol7aB2RT54 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Apol7aB2RT54 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Apol7aB2RT54 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Apol7aB2RT54 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Apol7aB2RT54 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Apol7aB2RT54 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Apol7aB2RT54 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Apol7aB2RT54 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Apol7aB2RT54 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Apol7aB2RT54 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Apol7aB2RT54 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Apol7aB2RT54 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Apol7aB2RT54 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Apol7aB2RT54 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Apol7aB2RT54 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC26.83■■□□□ 1.88
Apol7aB2RT54 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Apol7aB2RT54 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Apol7aB2RT54 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Apol7aB2RT54 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Apol7aB2RT54 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Apol7aB2RT54 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Apol7aB2RT54 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Apol7aB2RT54 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Apol7aB2RT54 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Apol7aB2RT54 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Apol7aB2RT54 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Apol7aB2RT54 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Apol7aB2RT54 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Apol7aB2RT54 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Apol7aB2RT54 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Apol7aB2RT54 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Apol7aB2RT54 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Apol7aB2RT54 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Apol7aB2RT54 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms