Protein–RNA interactions for Protein: B1AX85

6030498E09Rik, RIKEN cDNA 6030498E09 gene, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
6030498E09RikB1AX85 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
6030498E09RikB1AX85 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
6030498E09RikB1AX85 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
6030498E09RikB1AX85 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
6030498E09RikB1AX85 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
6030498E09RikB1AX85 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
6030498E09RikB1AX85 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
6030498E09RikB1AX85 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
6030498E09RikB1AX85 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
6030498E09RikB1AX85 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
6030498E09RikB1AX85 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
6030498E09RikB1AX85 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
6030498E09RikB1AX85 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
6030498E09RikB1AX85 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
6030498E09RikB1AX85 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
6030498E09RikB1AX85 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC25■■□□□ 1.59
6030498E09RikB1AX85 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
6030498E09RikB1AX85 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
6030498E09RikB1AX85 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
6030498E09RikB1AX85 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
6030498E09RikB1AX85 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
6030498E09RikB1AX85 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
6030498E09RikB1AX85 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
6030498E09RikB1AX85 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
6030498E09RikB1AX85 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
6030498E09RikB1AX85 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
6030498E09RikB1AX85 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
6030498E09RikB1AX85 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
6030498E09RikB1AX85 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
6030498E09RikB1AX85 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
6030498E09RikB1AX85 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
6030498E09RikB1AX85 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
6030498E09RikB1AX85 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
6030498E09RikB1AX85 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
6030498E09RikB1AX85 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
6030498E09RikB1AX85 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
6030498E09RikB1AX85 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
6030498E09RikB1AX85 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC24.95■■□□□ 1.59
6030498E09RikB1AX85 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
6030498E09RikB1AX85 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
6030498E09RikB1AX85 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
6030498E09RikB1AX85 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
6030498E09RikB1AX85 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
6030498E09RikB1AX85 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
6030498E09RikB1AX85 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
6030498E09RikB1AX85 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
6030498E09RikB1AX85 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
6030498E09RikB1AX85 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
6030498E09RikB1AX85 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
6030498E09RikB1AX85 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
6030498E09RikB1AX85 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
6030498E09RikB1AX85 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
6030498E09RikB1AX85 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
6030498E09RikB1AX85 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
6030498E09RikB1AX85 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
6030498E09RikB1AX85 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
6030498E09RikB1AX85 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
6030498E09RikB1AX85 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
6030498E09RikB1AX85 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
6030498E09RikB1AX85 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
6030498E09RikB1AX85 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
6030498E09RikB1AX85 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
6030498E09RikB1AX85 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
6030498E09RikB1AX85 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
6030498E09RikB1AX85 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
6030498E09RikB1AX85 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
6030498E09RikB1AX85 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
6030498E09RikB1AX85 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
6030498E09RikB1AX85 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
6030498E09RikB1AX85 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
6030498E09RikB1AX85 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
6030498E09RikB1AX85 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
6030498E09RikB1AX85 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
6030498E09RikB1AX85 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
6030498E09RikB1AX85 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
6030498E09RikB1AX85 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
6030498E09RikB1AX85 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
6030498E09RikB1AX85 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
6030498E09RikB1AX85 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
6030498E09RikB1AX85 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
6030498E09RikB1AX85 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
6030498E09RikB1AX85 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
6030498E09RikB1AX85 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
6030498E09RikB1AX85 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
6030498E09RikB1AX85 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
6030498E09RikB1AX85 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
6030498E09RikB1AX85 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
6030498E09RikB1AX85 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
6030498E09RikB1AX85 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
6030498E09RikB1AX85 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
6030498E09RikB1AX85 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
6030498E09RikB1AX85 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
6030498E09RikB1AX85 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
6030498E09RikB1AX85 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
6030498E09RikB1AX85 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
6030498E09RikB1AX85 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
6030498E09RikB1AX85 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
6030498E09RikB1AX85 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
6030498E09RikB1AX85 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
6030498E09RikB1AX85 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.5 ms