Protein–RNA interactions for Protein: B1AQL3

Tmem235, Transmembrane protein 235, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem235B1AQL3 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Tmem235B1AQL3 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Tmem235B1AQL3 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Tmem235B1AQL3 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Tmem235B1AQL3 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Tmem235B1AQL3 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Tmem235B1AQL3 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Tmem235B1AQL3 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Tmem235B1AQL3 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Tmem235B1AQL3 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Tmem235B1AQL3 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Tmem235B1AQL3 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Tmem235B1AQL3 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Tmem235B1AQL3 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Tmem235B1AQL3 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Tmem235B1AQL3 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Tmem235B1AQL3 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Tmem235B1AQL3 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Tmem235B1AQL3 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Tmem235B1AQL3 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Tmem235B1AQL3 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Tmem235B1AQL3 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Tmem235B1AQL3 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Tmem235B1AQL3 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Tmem235B1AQL3 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Tmem235B1AQL3 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Tmem235B1AQL3 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Tmem235B1AQL3 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Tmem235B1AQL3 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Tmem235B1AQL3 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Tmem235B1AQL3 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Tmem235B1AQL3 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Tmem235B1AQL3 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Tmem235B1AQL3 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Tmem235B1AQL3 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Tmem235B1AQL3 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Tmem235B1AQL3 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Tmem235B1AQL3 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Tmem235B1AQL3 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Tmem235B1AQL3 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Tmem235B1AQL3 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Tmem235B1AQL3 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Tmem235B1AQL3 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Tmem235B1AQL3 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Tmem235B1AQL3 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Tmem235B1AQL3 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Tmem235B1AQL3 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Tmem235B1AQL3 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Tmem235B1AQL3 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Tmem235B1AQL3 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Tmem235B1AQL3 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Tmem235B1AQL3 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Tmem235B1AQL3 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Tmem235B1AQL3 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Tmem235B1AQL3 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Tmem235B1AQL3 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Tmem235B1AQL3 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Tmem235B1AQL3 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Tmem235B1AQL3 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Tmem235B1AQL3 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Tmem235B1AQL3 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Tmem235B1AQL3 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Tmem235B1AQL3 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Tmem235B1AQL3 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Tmem235B1AQL3 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Tmem235B1AQL3 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Tmem235B1AQL3 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Tmem235B1AQL3 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Tmem235B1AQL3 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
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Tmem235B1AQL3 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Tmem235B1AQL3 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Tmem235B1AQL3 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Tmem235B1AQL3 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Tmem235B1AQL3 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Tmem235B1AQL3 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Tmem235B1AQL3 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tmem235B1AQL3 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tmem235B1AQL3 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Tmem235B1AQL3 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tmem235B1AQL3 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tmem235B1AQL3 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tmem235B1AQL3 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Tmem235B1AQL3 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tmem235B1AQL3 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Tmem235B1AQL3 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Tmem235B1AQL3 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Tmem235B1AQL3 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Tmem235B1AQL3 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tmem235B1AQL3 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tmem235B1AQL3 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tmem235B1AQL3 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tmem235B1AQL3 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tmem235B1AQL3 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tmem235B1AQL3 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tmem235B1AQL3 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tmem235B1AQL3 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Tmem235B1AQL3 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Tmem235B1AQL3 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Tmem235B1AQL3 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13 ms