Protein–RNA interactions for Protein: A7XV14

Skint11, Selection and upkeep of intraepithelial T-cells protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skint11A7XV14 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Skint11A7XV14 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Skint11A7XV14 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Skint11A7XV14 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Skint11A7XV14 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Skint11A7XV14 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Skint11A7XV14 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Skint11A7XV14 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Skint11A7XV14 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Skint11A7XV14 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Skint11A7XV14 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Skint11A7XV14 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Skint11A7XV14 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Skint11A7XV14 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Skint11A7XV14 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Skint11A7XV14 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Skint11A7XV14 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Skint11A7XV14 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Skint11A7XV14 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Skint11A7XV14 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Skint11A7XV14 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Skint11A7XV14 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Skint11A7XV14 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Skint11A7XV14 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Skint11A7XV14 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Skint11A7XV14 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Skint11A7XV14 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Skint11A7XV14 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Skint11A7XV14 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Skint11A7XV14 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Skint11A7XV14 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Skint11A7XV14 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Skint11A7XV14 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Skint11A7XV14 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Skint11A7XV14 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Skint11A7XV14 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Skint11A7XV14 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Skint11A7XV14 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Skint11A7XV14 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Skint11A7XV14 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Skint11A7XV14 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Skint11A7XV14 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Skint11A7XV14 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Skint11A7XV14 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Skint11A7XV14 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Skint11A7XV14 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Skint11A7XV14 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Skint11A7XV14 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Skint11A7XV14 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Skint11A7XV14 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Skint11A7XV14 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Skint11A7XV14 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Skint11A7XV14 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Skint11A7XV14 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Skint11A7XV14 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Skint11A7XV14 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Skint11A7XV14 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Skint11A7XV14 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Skint11A7XV14 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Skint11A7XV14 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Skint11A7XV14 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Skint11A7XV14 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Skint11A7XV14 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Skint11A7XV14 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Skint11A7XV14 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Skint11A7XV14 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Skint11A7XV14 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Skint11A7XV14 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Skint11A7XV14 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Skint11A7XV14 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Skint11A7XV14 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Skint11A7XV14 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Skint11A7XV14 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Skint11A7XV14 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Skint11A7XV14 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Skint11A7XV14 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Skint11A7XV14 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Skint11A7XV14 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Skint11A7XV14 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Skint11A7XV14 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Skint11A7XV14 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Skint11A7XV14 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Skint11A7XV14 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Skint11A7XV14 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Skint11A7XV14 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Skint11A7XV14 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Skint11A7XV14 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Skint11A7XV14 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Skint11A7XV14 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Skint11A7XV14 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Skint11A7XV14 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Skint11A7XV14 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Skint11A7XV14 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Skint11A7XV14 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Skint11A7XV14 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Skint11A7XV14 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Skint11A7XV14 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Skint11A7XV14 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Skint11A7XV14 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Skint11A7XV14 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.6 ms