Protein–RNA interactions for Protein: A7VMS3

H2-M5, Histocompatibility 2, M region locus 5, mousemouse

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Length 348 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M5A7VMS3 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
H2-M5A7VMS3 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
H2-M5A7VMS3 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
H2-M5A7VMS3 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
H2-M5A7VMS3 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
H2-M5A7VMS3 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
H2-M5A7VMS3 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
H2-M5A7VMS3 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
H2-M5A7VMS3 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
H2-M5A7VMS3 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
H2-M5A7VMS3 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
H2-M5A7VMS3 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
H2-M5A7VMS3 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
H2-M5A7VMS3 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
H2-M5A7VMS3 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
H2-M5A7VMS3 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
H2-M5A7VMS3 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
H2-M5A7VMS3 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
H2-M5A7VMS3 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
H2-M5A7VMS3 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
H2-M5A7VMS3 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
H2-M5A7VMS3 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
H2-M5A7VMS3 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
H2-M5A7VMS3 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
H2-M5A7VMS3 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
H2-M5A7VMS3 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
H2-M5A7VMS3 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
H2-M5A7VMS3 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
H2-M5A7VMS3 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
H2-M5A7VMS3 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
H2-M5A7VMS3 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
H2-M5A7VMS3 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
H2-M5A7VMS3 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
H2-M5A7VMS3 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
H2-M5A7VMS3 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
H2-M5A7VMS3 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
H2-M5A7VMS3 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
H2-M5A7VMS3 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
H2-M5A7VMS3 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
H2-M5A7VMS3 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
H2-M5A7VMS3 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
H2-M5A7VMS3 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
H2-M5A7VMS3 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
H2-M5A7VMS3 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
H2-M5A7VMS3 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
H2-M5A7VMS3 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
H2-M5A7VMS3 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
H2-M5A7VMS3 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
H2-M5A7VMS3 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
H2-M5A7VMS3 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
H2-M5A7VMS3 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
H2-M5A7VMS3 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
H2-M5A7VMS3 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
H2-M5A7VMS3 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
H2-M5A7VMS3 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
H2-M5A7VMS3 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
H2-M5A7VMS3 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
H2-M5A7VMS3 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
H2-M5A7VMS3 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
H2-M5A7VMS3 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
H2-M5A7VMS3 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
H2-M5A7VMS3 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
H2-M5A7VMS3 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
H2-M5A7VMS3 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
H2-M5A7VMS3 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
H2-M5A7VMS3 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
H2-M5A7VMS3 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
H2-M5A7VMS3 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
H2-M5A7VMS3 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
H2-M5A7VMS3 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
H2-M5A7VMS3 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
H2-M5A7VMS3 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
H2-M5A7VMS3 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
H2-M5A7VMS3 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
H2-M5A7VMS3 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
H2-M5A7VMS3 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
H2-M5A7VMS3 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
H2-M5A7VMS3 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
H2-M5A7VMS3 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
H2-M5A7VMS3 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
H2-M5A7VMS3 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
H2-M5A7VMS3 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
H2-M5A7VMS3 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
H2-M5A7VMS3 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
H2-M5A7VMS3 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
H2-M5A7VMS3 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
H2-M5A7VMS3 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
H2-M5A7VMS3 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
H2-M5A7VMS3 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
H2-M5A7VMS3 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
H2-M5A7VMS3 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
H2-M5A7VMS3 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
H2-M5A7VMS3 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
H2-M5A7VMS3 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
H2-M5A7VMS3 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
H2-M5A7VMS3 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
H2-M5A7VMS3 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
H2-M5A7VMS3 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
H2-M5A7VMS3 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
H2-M5A7VMS3 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.1 ms