Protein–RNA interactions for Protein: A4Q9E5

Ttll3, Tubulin monoglycylase TTLL3, mousemouse

Predictions only

Length 927 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttll3A4Q9E5 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ttll3A4Q9E5 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ttll3A4Q9E5 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ttll3A4Q9E5 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ttll3A4Q9E5 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ttll3A4Q9E5 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ttll3A4Q9E5 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ttll3A4Q9E5 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ttll3A4Q9E5 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ttll3A4Q9E5 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ttll3A4Q9E5 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ttll3A4Q9E5 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ttll3A4Q9E5 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ttll3A4Q9E5 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ttll3A4Q9E5 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ttll3A4Q9E5 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ttll3A4Q9E5 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ttll3A4Q9E5 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ttll3A4Q9E5 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ttll3A4Q9E5 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ttll3A4Q9E5 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ttll3A4Q9E5 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ttll3A4Q9E5 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ttll3A4Q9E5 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ttll3A4Q9E5 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ttll3A4Q9E5 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ttll3A4Q9E5 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ttll3A4Q9E5 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ttll3A4Q9E5 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ttll3A4Q9E5 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ttll3A4Q9E5 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ttll3A4Q9E5 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ttll3A4Q9E5 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ttll3A4Q9E5 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ttll3A4Q9E5 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ttll3A4Q9E5 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ttll3A4Q9E5 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Ttll3A4Q9E5 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ttll3A4Q9E5 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ttll3A4Q9E5 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ttll3A4Q9E5 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ttll3A4Q9E5 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ttll3A4Q9E5 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ttll3A4Q9E5 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Ttll3A4Q9E5 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ttll3A4Q9E5 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ttll3A4Q9E5 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ttll3A4Q9E5 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ttll3A4Q9E5 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ttll3A4Q9E5 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ttll3A4Q9E5 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ttll3A4Q9E5 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ttll3A4Q9E5 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ttll3A4Q9E5 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Ttll3A4Q9E5 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Ttll3A4Q9E5 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ttll3A4Q9E5 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ttll3A4Q9E5 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ttll3A4Q9E5 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ttll3A4Q9E5 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ttll3A4Q9E5 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ttll3A4Q9E5 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ttll3A4Q9E5 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ttll3A4Q9E5 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ttll3A4Q9E5 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ttll3A4Q9E5 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ttll3A4Q9E5 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ttll3A4Q9E5 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ttll3A4Q9E5 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ttll3A4Q9E5 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ttll3A4Q9E5 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ttll3A4Q9E5 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ttll3A4Q9E5 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ttll3A4Q9E5 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ttll3A4Q9E5 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ttll3A4Q9E5 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ttll3A4Q9E5 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ttll3A4Q9E5 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ttll3A4Q9E5 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ttll3A4Q9E5 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ttll3A4Q9E5 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ttll3A4Q9E5 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Ttll3A4Q9E5 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ttll3A4Q9E5 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ttll3A4Q9E5 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ttll3A4Q9E5 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ttll3A4Q9E5 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ttll3A4Q9E5 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ttll3A4Q9E5 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Ttll3A4Q9E5 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ttll3A4Q9E5 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ttll3A4Q9E5 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ttll3A4Q9E5 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ttll3A4Q9E5 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ttll3A4Q9E5 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ttll3A4Q9E5 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Ttll3A4Q9E5 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ttll3A4Q9E5 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ttll3A4Q9E5 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ttll3A4Q9E5 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.4 ms