Protein–RNA interactions for Protein: A3KGV1

Odf2, Outer dense fiber protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 830 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Odf2A3KGV1 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Odf2A3KGV1 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Odf2A3KGV1 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Odf2A3KGV1 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Odf2A3KGV1 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
Odf2A3KGV1 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Odf2A3KGV1 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Odf2A3KGV1 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Odf2A3KGV1 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Odf2A3KGV1 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Odf2A3KGV1 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
Odf2A3KGV1 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Odf2A3KGV1 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Odf2A3KGV1 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
Odf2A3KGV1 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Odf2A3KGV1 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Odf2A3KGV1 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Odf2A3KGV1 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Odf2A3KGV1 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Odf2A3KGV1 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Odf2A3KGV1 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Odf2A3KGV1 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Odf2A3KGV1 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
Odf2A3KGV1 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
Odf2A3KGV1 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Odf2A3KGV1 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Odf2A3KGV1 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Odf2A3KGV1 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
Odf2A3KGV1 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Odf2A3KGV1 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Odf2A3KGV1 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Odf2A3KGV1 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Odf2A3KGV1 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Odf2A3KGV1 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Odf2A3KGV1 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Odf2A3KGV1 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
Odf2A3KGV1 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Odf2A3KGV1 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Odf2A3KGV1 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Odf2A3KGV1 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Odf2A3KGV1 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Odf2A3KGV1 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Odf2A3KGV1 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Odf2A3KGV1 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Odf2A3KGV1 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Odf2A3KGV1 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Odf2A3KGV1 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Odf2A3KGV1 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Odf2A3KGV1 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Odf2A3KGV1 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Odf2A3KGV1 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
Odf2A3KGV1 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
Odf2A3KGV1 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Odf2A3KGV1 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Odf2A3KGV1 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Odf2A3KGV1 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Odf2A3KGV1 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
Odf2A3KGV1 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Odf2A3KGV1 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Odf2A3KGV1 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
Odf2A3KGV1 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Odf2A3KGV1 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Odf2A3KGV1 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Odf2A3KGV1 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Odf2A3KGV1 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Odf2A3KGV1 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Odf2A3KGV1 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Odf2A3KGV1 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Odf2A3KGV1 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Odf2A3KGV1 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Odf2A3KGV1 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Odf2A3KGV1 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Odf2A3KGV1 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Odf2A3KGV1 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Odf2A3KGV1 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Odf2A3KGV1 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Odf2A3KGV1 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Odf2A3KGV1 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Odf2A3KGV1 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Odf2A3KGV1 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Odf2A3KGV1 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Odf2A3KGV1 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Odf2A3KGV1 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Odf2A3KGV1 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Odf2A3KGV1 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
Odf2A3KGV1 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Odf2A3KGV1 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Odf2A3KGV1 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Odf2A3KGV1 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Odf2A3KGV1 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Odf2A3KGV1 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Odf2A3KGV1 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Odf2A3KGV1 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Odf2A3KGV1 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Odf2A3KGV1 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Odf2A3KGV1 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Odf2A3KGV1 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Odf2A3KGV1 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Odf2A3KGV1 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Odf2A3KGV1 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms